CiteULike CiteULike
Delicious Delicious
Connotea Connotea

Matrix 3297 of Study 2103

About Citation title: "Brassicaceae phylogeny inferred from phytochrome A and ndhF sequence data: tribes and trichomes revisited".
About This study was previously identified under the legacy study ID S2106 (Status: Published).

Matrices

Title: PHYA

Description: Legacy TreeBASE Matrix ID = M3967

Rows

Taxon Label Row Segments Characters 1?–30
Neuontobotrys frutescens 2  (none) GACTTTGAGCCCGTGAAGCCTTATGAAGTT
Smelowskia calycina  (none) GACTTTGAGCCAGTGAAGCCTCACGAAGTT
Solms-laubachia zhongdianensis  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Smelowskia annua  (none) GACTTTGAGCCGGTTAAGCCTTACGAAGTT
Stanleya pinnata 1  (none) GACTTTGAACCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Stanleya pinnata 2  (none) GACTTTGAACCGGTCAAGCCTTACGAAGTT
Streptanthus squamiformis  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Synthlipsis greggii  (none) GACTTTGAACCCGTGAAGCCTTACGAAGTT
Tetracme pamirica  (none) GACTTTGAACCTGTGAAGCCTTACGAAGTT
Thelypodium laciniatum 1  (none) GACTTTGAGCCGGTCAAGCCTTACGAAGTT
Thelypodium laciniatum 2  (none) GACTTTGAGCCGGTTAAGCCTTACGAAGTT
Turritis glabra  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTATGAAGTT
Eutrema altaicum  (none) GACTTTGAGCCGGTCAAGCCTTACGAAGTT
Thlaspi arvense  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Aethionema saxatile  (none) ?????????????????TCCCTACGAGGTG
Alliaria petiolata  (none) GACTTTGAGCCGGTCAAGCCTTACGAAGTT
Alyssum canescens  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Alyssum linifolium  (none) GACTTTGAGCCTGTGAAGCCTTATGAAGTT
Arabidopsis lyrata  (none) GACTTTGAGCCAGTCAAGCCTTATGAAGTC
Arabidopsis thaliana 1  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTC
Arabidopsis thaliana genBank  (none) GACTTTGAACCCGTGAAGCCTTATGAAGTC
Arabis alpina  (none) GACTTTGAGCCAGTTAAGCCTTACGAAGTT
Asta schaffneri  (none) GACTTTGAGCCTGTCAAGCCTTACGAAGTC
Aubrieta deltoidea  (none) GACTTTGAGCCCGTTAAGCCTTATGAAGTT
Aubrieta parviflora  (none) GACTTTGAGCCGGTTAAGCCTTATGAAGTT
Baimshania pulvinata  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Barbarea vulgaris  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTATGAAGTT
Biscutella didyma  (none) GACTTTGAGCCGGTCAAGCCTTATGAGGTT
Boechera platysperma  (none) GACTTTGAGCCAGTGAAGCCTTACGAAGTT
Boechera shortii  (none) ??????GAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Brassica oleracea 1s  (none) GACTTTGAGCCTGTGAAGCCTTACGAAGTT
Brassica oleracea 1l  (none) GACTTTGAGCCTGTGAAGCCTTACGAAGTT
Bunias orientalis  (none) GACTTTGAGCCTGTCAAGCCTTACGAAGTT
Cakile maritima  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Camelina microcarpa  (none) GACTTTGAGCCTGTGAAGCCTTACGAAGTT
Capsella bursa pastoris  (none) GACTTTGAGCCGGTCAAGCCTTATGAAGTT
Cardamine pulchella  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTATGAAGTT
Catolobus pendula  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Caulanthus crassicaulis 1  (none) GACTTTGAGCCTGTCAAGCCTTACGAAGTT
Caulanthus crassicaulis 2  (none) GACTTTGAGCCGGTTAAGCCTTATGAAGTT
Hesperidanthus jaegeri  (none) GACTTTGAGCCCGTGAAGCCTTACGAAGTT
Chalcanthus renifolius  (none) GACTTTGAGCCGGTTAAGCCTTACGAAGTT
Chorispora tenella  (none) GACTTTGAGCCTGTGAAGCCTTATGAAGTT
Christolea crassifolia  (none) GACTTTGAGCCGGTCAAGCCTTACGAAGTT
Clypeola aspera  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTATGAAGTT
Conringia persica  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTATGAAGTT
Cremolobus subscandens  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTC
Cusickiella quadricostata  (none) GACTTTGAACCCGTGAAGCCTTACGAAGTT
Descurainia sophia  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTATGAAGTT
Desideria linearis  (none) GACTTTGAGCCAGTCAAGCCTTATGAAGTT
Dilophia salsa  (none) GACTTTGAGCCGGTTAAGCCTTACGAAGTT
Dimorphocarpa wislizenii  (none) GACTTTGAGCCTGTCAAGCCTTACGAAGTT
Dontostemon senilis  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTATGAAGTT
Erysimum capitatum  (none) GACTTTGAGCCAGTGAAGCCTTACGAAGTT
Euclidium syriacum  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTATGAAGTT
Eutrema heterophyllum  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Farsetia aegyptica  (none) GACTTTGAGCCTGTGAAGCCTTACGAAGTT
Fibigia suffruticosa  (none) GACTTTGAGCCTGTGAAGCCTTACGAAATT
Hesperidanthus suffrutescens 1  (none) GACTTTGAGCCAGTTAAGCCTTACGAAGTT
Hesperidanthus suffrutescens 2  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTATGAAGTT
Goldbachia laevigata  (none) GACTTTGAGCCGGTCAAGCCTTACGAAGTC
Exhalimolobos weddellii  (none) GACTTTGAGCCTGTGAAGCCTTATGAAGTT
Smelowskia tibetica  (none) ????????????GTGAAGCCTTATGAAGTT
Heliophila sp  (none) GACTTTGAGCCTGTTAAGCCTTATGAAGTC
Hesperis matronalis  (none) GACTTTGAGCCTGTGAAGCCTTACGAAGTT
Hesperis sp nov  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Hirschfeldia incana 1s  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAGGTT
Hirschfeldia incana 1l  (none) GACTTTGAACCGGTCAAGCCTTATGAAGTT
Hornungia procumbens  (none) GACTTTGAGCCGGTCAAGCCTTACGAAGTT
Ianhedgea minutiflora  (none) GACTTTGAGCCGGTCAAGCCTTACGAAGTT
Idahoa scapigera 1  (none) ????????????GTTAAGCCTTACGAAGTC
Idahoa scapigera 2  (none) GACTTTGAGCCTGTTAAGCCTTATGAAATC
Iodanthus pinnatifidus  (none) GACTTTGAACCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Isatis tinctoria  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Leiospora eriocalyx  (none) GACTTTGAGCCAGTTAAGCCTTACGAAGTT
Lepidium draba  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Lepdium alyssoides  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Lunaria annua  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Strigosella africana  (none) GACTTTGAACCAGTGAAGCCTTACGAAGTT
Mancoa hispida  (none) GACTTTGA{AG}CCGGTGAAGCCTTATGAA
Matthiola farinosa  (none) GACTTTGAGCCAGTGAAGCCTTATGAAGTT
Matthiola integrifolia  (none) GACTTTGAGCCGGTCAAGCCTTATGAAGTT
Moriera spinosa  (none) GCCTTTGAGCCAGTGAAGCCTTATGAAGTT
Mostacillastrum orbignyanum 1  (none) GACTTTGAACCAGTGAAGCCTTACGAAGTT
Mostacillastrum orbignyanum 2  (none) GACTTTGAGCCAGTGAAGCCTTATGAAGTT
Myagrum perfoliatum  (none) GACTTTGAGCCTGTGAAGCCTTACGAAGTT
Nerisyrenia johnstonii  (none) GACTTTGAGCCGGTTAAGCCTTACGAAGTT
Neotorularia korolkowii  (none) ????????????????????????GAAGTT
Neuontobotrys elloanensis 1  (none) GGCTTTGAGCCGGTTAAGCCTTACGAAGTT
Neuontobotrys elloanensis 2  (none) GACTTTGAACCGGTTAAGCCTTACGAAGTT
Nevada holmgrenii  (none) GACTTTGAGCCGGTTAAGCCTTATGAAGTT
Noccaea cochleariforme  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Noccaea Iran sp1  (none) GACTTTGAGCCCGTGAAGCCTTATGAAGTT
Noccaea Iran sp2  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTATGAAGTT
Olimarabidopsis pumila  (none) GACTTTGAGCCTGTGAACCCTTACGAAGTT
Oreoloma violaceum  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTA
Pennellia brachycarpa  (none) GACTTTGAGCCAGTGAAGCCTTATGAAGTT
Planodes virginicum  (none) GACTTTGAACCGGTGAAGCCTTACGAAGTC
Physaria floribunda  (none) GACTTTGAGCCCGTCAAGCCTTACGAAGTT
Physaria rosei  (none) GACTTTGAGCCCGTCAAGCCTTACGAAGTT
Polanisia dodecandra  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTATGAAGTT
Polyctenium fremontii  (none) GACTTTGAGCCAGTCAAGCCTTATGAAGTT
Pseudocamelina campylopoda  (none) GACTTTGAACCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Rhammatophyllum erysimoides  (none) GACTTTGAGCCAGTGAAGCCTTACGAAGTT
Robeschia schimperii  (none) GACTTTGAGCCAGTGAAGCCTTACGAAGTT
Romanschulzia 2sp  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTATGAAGTT
Romanschulzia 1sp  (none) GACTTTGAGCCCGTGAAGCCTTATGAAGTT
Schizopetalon rupestre  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTC
Sisymbrium linifolium  (none) GACTTTGAGCCTGTGAAGCCTTACGAAGTT
Shangrilaia nana  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTATGAAGTT
Sisymbriopsis mollipila  (none) GACTTTGAGCCTGTTAAGCCTTACGAAGTT
Sisymbriopsis yechengnica 1  (none) ??????GAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Sisymbriopsis yechengnica 2  (none) GACTTTGAGCCTGTTAAGCCTTACGAAGTT
Sisymbrium altissimum  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT
Neuontobotrys frutescens 1  (none) GACTTTGAGCCGGTGAAGCCTTACGAAGTT

Columns

None of the columns has a description.