NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  21:13:17]
[Matrix accession#: M2762]

BEGIN TAXA;
	TITLE M2762;
	DIMENSIONS  NTAX=27;
	TAXLABELS
		Jardinella_isolata	Austropyrgus_rectus	Fonscochlea_zeidleri	Trochidrobia_punicea	Caldicochlea_harrisi_H1_4	Caldicochlea_harrisi_H1_2	Caldicochlea_harrisi_H1_1	Caldicochlea_harrisi_E1_5	Caldicochlea_harrisi_E1_4	Caldicochlea_harrisi_E1_3	Caldicochlea_harrisi_E1_1	Caldicochlea_harrisi_Db4_1	Caldicochlea_harrisi_Cd1_3	Caldicochlea_harrisi_Db4_5	Caldicochlea_globosa_Ca5B_5	Caldicochlea_globosa_Cd1_4	Caldicochlea_globosa_Cd1_5	Caldicochlea_globosa_Cd1_1	Caldicochlea_globosa_Ca1_6	Caldicochlea_globosa_Ca1_1	Caldicochlea_globosa_Ca1_4	Caldicochlea_harrisi_Ca1_3	Caldicochlea_globosa_A1_1	Caldicochlea_globosa_A1_4	Caldicochlea_globosa_A1_3	Caldicochlea_globosa_A1_2	Caldicochlea_globosa_A1_5
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M2762;
	DIMENSIONS NCHAR=540;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Jardinella_isolata                TTTATTAATTCGAGCAGAATTAGGACAGCCAGGAGCCTTATTAGGAGATGATCAACTTTATAACGTGATTGTTACTGCTCATGCTTTTGTCATAATTTTCTTTTTGGTAATACCTATGATAATTGGTGGATTTGGGAATTGATTAATTCCTTTAATATTAGGTGCTCCGGATATAGCTTTTCCACGTTTAAATAATATAAGATTTTGATTATTGCCCCCTGCTTTGTTGCTATTATTATCCTCAGCTGCAGTAGAAAGAGGTGCTGGGACTGGATGAACTGTATATCCTCCTCTGGCTGGAAATATTGCTCATGCAGGTGGTTCTGTTGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACTTAGCTGGTGTATCTTCAATTTTAGGGGCAGTTAATTTTATTACGACAGTTATTAATATACGATGACGTGGAATGCAACTTGAGCGTCTGCCATTATTTGTTTGATCGGTAAAAATTACGGCTATTTTACTTTTACTTTCTTTACCTGTATTAGCTGGAGGTATTACAATATTGTTAACAGATCGAAA
		Austropyrgus_rectus               TTTATTAATTCGAGCTGAACTTGGCCAGCCAGGTGCGTTATTGGGGGATGATCAGCTTTATAATGTAATTGTTACAGCTCATGCATTTGTTATAATTTTTTTCTTAGTGATGCCTATAATAATTGGAGGATTTGGAAATTGGCTAATTCCTTTAATGTTGGGGGCTCCAGATATGGCTTTCCCCCGATTAAATAATATAAGATTTTGATTGTTGCCCCCAGCTCTACTTTTACTTCTGTCTTCTGCAGCAGTTGAAAGTGGTGCTGGGACTGGGTGAACTGTATACCCTCCACTAGCAAGAAATATTGCTCATGCCGGGGGATCTGTAGATTTGGCTATTTTTTCTTTACATTTAGCGGGTGTTTCTTCTATTTTAGGTGCAGTAAATTTTATTACCACAGTAATTAATATACGTTGACGGGGAATACAATTTGAGCGTCTTCCTCTCTTTGTTTGATCTGTAAAAATCACAGCAATTCTTCTTTTACTTTCTTTGCCTGTTTTAGCTGGAGCAATTACAATGTTATTAACAGACCGGAA
		Fonscochlea_zeidleri              TTTATTAATTCGAGCAGAACTTGGGCAACCAGGAGCATTATTAGGAGATGATCAACTTTATAATGTTATTGTTACCGCTCATGCTTTTGTTATAATTTTTTTTTTAGTTATACCTATAATAATTGGAGGATTTGGAAATTGATTAGTTCCTCTTATATTAGGGGCTCCAGATATAGCTTTTCCCCGTTTAAATAATATAAGATTTTGATTATTACCTCCTGCTTTACTACTATTATTATCTTCAGCTGCAGTAGAAAGGGGGGCTGGGACAGGATGAACAGTATATCCACCTTTAGCAGGTAATATTGCTCATGCTGGTGGATCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACATTTAGCAGGGGCTTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACGGTAATTAATATACGTTGACGTGGAATGCAGTTTGAACGTCTTCCTCTTTTTGTTTGATCTGTAAAAATTACTGCTATTTTATTATTGCTTTCATTACCTGTTTTGGCGGGGGCTATTACGATGTTATTAACTGATCGAAA
		Trochidrobia_punicea              ACTATTAATTCGAGCAGAACTAGGACAACCAGGGGCTCTTTTAGGAGATGATCAGCTTTATAACGTTATTGTTACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTCTTAGTTATGCCTATAATAATTGGTGGATTTGGAAATTGATTGATTCCTTTAATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGATTATTACCTCCTGCTTTACTATTATTATTATCATCAGCTGCAGTTGAAAGAGGAGTAGGAACAGGATGAACAGTGTATCCACCTCTAGCTGGAAATATTGCACATGCTGGGGGATCTGTAGATTTAGCAATTTTTTCATTACATTTAGCTGGTGTTTCTTCTATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATTACAACTGTAATTAATATACGTTGACGTGGAATACAATTTGAGCGGCTTCCTTTATTTGTATGATCGGTAAAAATTACTGCTATTTTATTATTACTTTCATTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGAAA
		Caldicochlea_harrisi_H1_4         CTTACTAATCCGAGCAGAACTTGGTCACCCAGGA?CACTTT??GGAGACGA?CAACTTTATAATGTTATTGTTACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTCTTAGTAATACCTATAATAATCGGGGGATTTGGTAACTGACTA?TCCCTCTTATACTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTT?AAATAATATAAGATTTTGATT?CTACCTCCTGCCTTATTATTACTATTGTCTTCA?CTGCAGTAGAAAGAGGGGT?GGGACAGGATGAACAGTCTATCCACCTCTAGCGGG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Caldicochlea_harrisi_H1_2         ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AACTGACTAATCCCTCTTATACTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGATTACTACCTCCTGCCTTATTATTACTATTGTCTTCAGCTGCAGTAGAAAGAGGGGTTGGGACAGGATGAACAGTCTATCCACCTCTAGCGGGTAATATCGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCGGGAGCCTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTT?ATTACAACAGTAATTAATATGCGCTGACGAGGGATACAGCTTGAACGCCTTCCTCTTTTCGTTTGGTCTGTAAAAATTACTGCTATTTTGTTGTTACTT?CATT?CCTGTTTTAGCAGGAGCTAT?ACAA???????????????????
		Caldicochlea_harrisi_H1_1         ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TCGGGGGATTTGGTAACTGACTAATCCCTCTTATACTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGATTACTACCTCCTGCCTTATTATTACTATTGTCTTCAGCTGCAGTAGAAAGAGGGGTTGGGACAGGATGAACAGTCTATCCACCTCTAGCGGGTAATATCGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCGGGAGCCTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATGCGCTGACGAGGGATACAGCTTGAACGCCTTCCTCTTTTCGTTTGGTCTGTAAAAATTACTGCTATTT?GTTGTTACTTTCATTACCTGTTTTAGCAGGAGCTAT????????????????????????
		Caldicochlea_harrisi_E1_5         ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATAATAAT??GGGGATTTGGTAA?TGACTAGTCCCTCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGATTACTACCTCCTGCCTTATTATTACTATTGTCTTCAGCTGCAGTAGAAAGAGGGGTTGGAACAGGATGAACAGTGTATCCACCTCTAGCGGGTAATATCGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCGGGAGCCTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATACGCTGACGAGGGATACAGCTTGAACGCCTTCCTCTTTTCGTTTGGTCTGTAAAAATTACTGCTATTTTGTTGTTACTTTCATTACCTGTTTTAGCAGGAGCTAT?TC?????????????????????
		Caldicochlea_harrisi_E1_4         CTTACTAATCCGAGCAGAACTTGGTCACCCAG?AGCATT?TTAGGAGACGATCAACTTTATAATGTTATTGTTACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTCTTAGTAATACCTATAATAATTGGGGGATTTGGTAACTGACTAGTCCCTCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGATTACTACCTCCTGCCTTATTATTATTATTGTCTTCAGCTGCAGTAGAAAGAGGGGTTGGAACAGGATGAACAGTGTATCCACCTCTAGCGGGTAATATCGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCGGGAGCCTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATACGCTGACGAGGGATACAGCTTGAACGCCTTCCTCTTTTCGTTTGGTCTGTAAAAATTACTGCTATTTTGTTGTTACTTTCATTACCTGTTTTAGCAGGAGCTATT???????????????????????
		Caldicochlea_harrisi_E1_3         ?CTTCTAATCCGAGCAGAACTTGGTCACCCAGAACATTTA???GGAGACGATCAACTTTATAATGTTAT?GTTACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTT?TTTCTAGTAATACCTATAATAATTGGGGGATTTGGTAACTGACTAGTCCCTCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGATTACTACCTCCTGCCTTATTATTACTATTGTCTTCAGCTGCAGTAGAAAGAGGGGTTGGAACAGGATGAACAGTGTATCCACCTCTAGCGGGTAATATCGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCGGGAGCCTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATACGCTGACGAGGGATACAGCTTGAACGCCTTCCTCTTTTCGTTTGGTCTGTAAAAATTACTGCTATTTTGTTGTTACTTTCATTACCTG????????????????????????????????????????
		Caldicochlea_harrisi_E1_1         CTT?CTAATCCGAGCAGAACTTGGTCACCCAGAA????TTTTAGGAGACGATCAACTTTATAATGTTATTGT?ACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTCTTAGTAATACCTATAATAAT?GGGGGATTTGGTAACTGACTAGTCCCTCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGATTACTACCTCCTGCCTTATTATTACTATTGTCTTCAGCTGCAGTAGAAAGAGGGGTTGGAACAGGATGAACAGTGTATCCACCTCTAGCGGGTAATATCGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCGGGAGCCTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATAT?CGCTGACGAGGGATACAGCTTGAACGCCTTCCTCTTTTCGTTTGGTCTGTAAAAATTACTGCTATTTTGTTGTTACTTTCATTACCTGTTTTAGCAGGAGCTATT???????????????????????
		Caldicochlea_harrisi_Db4_1        CTTACTAATCCGAGCAGAACTTGGTCACCCAGAAGTATTTT?AGGAGACGATCAGCTTTATAATGTTATTGTTACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTCTTAGTAATACCTATAATAATTGGGGGATTTGGCAACTGACTAATCCCTCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGATTACTACCTCCTGCCTTATTATTACTATTGTCTTCAGCTGCAGTAGAAAGAGGGGTTGGAACAGGATGAACAGTGTATCCACCTCTAGCGGGTAATATCGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCAGGAGCCTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATGCGCTGACGAGGGATACAGCTTGAACGCCTTCCTCTTTTCGTTTGGTCTGTAAAAATTACTGCTATTTTGTTGT?ACTTTCATTACCTGTTTTAGCAGGAGCTATT???????????????????????
		Caldicochlea_harrisi_Cd1_3        ?CTTCTAATC?GAGCAGAACTTGGTCAACCGGGGACATTATTAGGAGACGATCAACTTTATAATGTTATTGTTACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTCTTAGTAATACCTATAATAATTGGGGGATTTGGTAACTGATTGATTCCTCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGGTTACTACCTCCTGCCTTATTATTATTATTATCTTCAGCTGCAGTGGAAAGAGGGGTTGGGACAGGATGAACAGTGTACCCACCTCTAGCGGGTAATATTGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCTGGAGCTTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATACGCTGACGAG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Caldicochlea_harrisi_Db4_5        CTTACTAATCCGAGCAGAACTTGGTCACCCAGAGA???TATTTAGAGACGATCAGCTTTATAATGTTATTGTTACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTCTTAGTAATACCTATAATAATTGGGGGATTTGGCAACTGACTAATCCCTCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGATTACTACCTCCTGCCTTATTATTACTATTGTCTTCAGCTGCAGTAGAAAGAGGGGTTGGAACAGGATGAACAGTGTATCCACCTCTAGCGGGTAATATCGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCAGGAGCCTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATGCGCTGACGAGGGATACAGCTTGAACGCCTTCCTCTTTTCGTTTGGTCTGTAAAAATTACTGCTATTTTGTTGTTACTTTCATTACCTGTTTTAGCAGGAGCTATT???????????????????????
		Caldicochlea_globosa_Ca5B_5       CTTACTAATCCGAGCAGAACTTGGTCAACCAGGAACACTATTAGGAGACGATCAACTTTATAATGTTATTGTTACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTTTTAGTAATACCTATAATAATTGGGGGATTTGGTAACTGACTAGTCCCTCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGATTACTACCTCCTGCCTTATTATTACTATTGTCTTCAGCTGCAGTAGAAAGAGGGGTTGGAACAGGATGAACAGTGTATCCACCTYTAGCGGGTAATATCGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCGGGAGCCTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATACGCTGACGAGGGATACAGCTTGAACGCCTTCCTCTTTTCGTTTGGTCTGTAAAAATTACTGCTATTTTATTGTTACTTTCACTACCTGTTTTAGCAGGAGCTATTACAATATTGTTAACTGATCGAAA
		Caldicochlea_globosa_Cd1_4        ?????????????GCAGA?CTTGGTCAACCGGGGACATTATTAGGAGACGATCAACTTTATAATGTTATTGTTACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTCTTAGTAATACCTATAATAATTGGGGGATTTGGTAACTGATTGATTCCTCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGGTTACTACCTCCTGCCTTATTATTATTATTATCTTCAGCTGCAGTGGAAAGAGGGGTTGGGACAGGATGAACAGTGTACCCACCTCTAGCGGGTAATATTGCTCATGCTGGAGGGTCTGTA?ATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCTGGAGCTTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATACGCTGACGAGGAATGCA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Caldicochlea_globosa_Cd1_5        ??????????????????ACTTGGTCA?CCGGGGACATTATTAGGAGACGATCAACTTTATAATGTTATTGTTACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTCTTAGTAATACCTATAATAATTGGGGGATTTGGTAACTGATTGATTCCTCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGGTTACTACCTCCTGCCTTATTACTATTATTATCTTCAGCTGCAGTGGAAAGAGGGGTTGGGACAGGATGAACAGTGTACCCACCTCTAGCGGGTAATATTGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCTGGAGCTTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATACGCTGACGAGGAATGCAGCTTGAGCGCCTTCCTCTTTTCGTTTGGTCTGTAAAAATTACTGCTATTTTATTATTACTTTCATTACCTGTCTTAGCAGGAGCTATTACAATATTGT?AACTGATCGAAA
		Caldicochlea_globosa_Cd1_1        CTTATTAATTCGAGCAGAACTTGGTCA?CCGGGAACATTATT?GGAGACGATCAACTTTATAATGTTATTGTTACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTCTTAGTAATACCTATAATAATTGGGGGATTTGGTAACTGATTAATTCCTCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAG?TTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGGTTACTACCTCCTGCCTTATTATTATTATTATCTTCAGCTGCAGTGGAAAGAGGGGTTGGGACAGGATGAACAGTGTACCCACCTCTAGCGGGTAATATTGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCTGGAGCTTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATACGCTGACGAGGAATGCAGCTTGAGCGCCTTCCTCTTTTCGTTTGGTCTGTAAAAATTACTGCTATTTTATTATTACTTTCATTACCTGTCTTAGCAGGAGCTATTACAATATTGTTAACTGATCGAAA
		Caldicochlea_globosa_Ca1_6        CTTATTAATTCGAGCCGAACTTGGTCAACCGGGAACATTATTAGGAGACGA?CAACTTTATAATGGTATTGGTACTG?ACATGCTTTTGGTATAATTTTTTTCTTAGTAATACCTATAATAATTGGGGGATTTGGTAACTGATTAATTCCTCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCT?GTTTAAATAATATAAGATTTTGG??ACTACCTCCTGCTTTATTATTATTAT??ACTTCAGCTGCAGTGGAAAGAGGGGTTGGGACAGGATGAACAGTGTATCCACCTTTACCGGGTAATATCGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCTGGAGCTTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATACGCTGACGAGGAATGCAGCTTGAGCGCCTTCCTCTTTTCGTTTGGTCTGTAAAAATTACTGCTATTTTATTATTACTTTCATTACCTGTCTTAGCAGGAGCTATTACAATATTGTTAACTGATCGAAA
		Caldicochlea_globosa_Ca1_1        ??????????????????ACTTGGTCACCGGGGAACATTATTAGGAGACGATCAACTTTATAATGTTATTGTTACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTCTTAGTAATACCTATAATAATTGGGGGATTTGGTAACTGATTGATTCCTCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGGCTACTACCTCCTGCCTTATTATTATTATTATCTTCAGCTGCAGTGGAAAGAGGGGTTGGGACAGGATGAACAGTGTACCCACCTCTAGCGGGTAATATTGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCTGGAGCCTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATACGCTGACGAGGAATGCAGCTTGAGCGCCTTCCTCTTTTCGTTTGGTCTGTAAAAATTACTGCTATTTTATTATTACTTTCATTACCTGTCTTAGCAGGAGCTATTACAATATTGT?AACTGATCGAAA
		Caldicochlea_globosa_Ca1_4        CTTATTAATTCGAGCAGAACTTGGTCAACCGGGAACATTATTAGGAGACGATCAACTTTATAATGT?ATTGT?ACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTCTTAGTAATACCTATAATAATTGGGGGATTTGGTAACTGATTGATTCCTCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGGTTACTACCTCCTGCCTTATTATTATTATTATCTTCAGCTGCAGTGGAAAGAGGGGTTGGGACAGGATGAACAGTGTACCCACCTCTAGCGGGTAATATTGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCTGGAGCTTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATACGCTGACGAGGAATGCAGCTTGAGCGCCTTCCTCTTTTCGTTTGGTCTGTAAAAATTACTGCTATTT?ATTAT?ACTTTCATTACCTGTCTTAGCAGGAGCTATTACAATATTGTTAACTGATCGAAA
		Caldicochlea_harrisi_Ca1_3        CTTATTAATTCGAGCAGAACTTGGTCAACCAGGAGCATTATTAGGAGACGATCAGCTTTATAATGTCATTGTTACTGCTCATGCTTTTGTTATAATTTTTTTCTCAGTAATGCCTATAATAATTGGGGGATTTGGTAATTGATTAATCCCTCTTATATTAGGAGCTCCA?ATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGATTGCTACCTCCTGCCTTATTATTATTACTGTCTTCAGCTGCAGTAGAAAGAGGGGTCGGAACAGGATGAACAGTGTACCCACCTTTAGCAGGCAATAATGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACATTTAGCAGGAGTTTCTTCTATTTTGGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATGCATTGACGAGGGATACAACTTGAACGCCTTCCTCTTTTCGTTTGATCTGTAAAAATTACTGCTATTTTGTTATTACTTTCATTACCTGTTTTAGCAGGAGCTATTACAATACTGTTAACTGATCGAAA
		Caldicochlea_globosa_A1_1         CTTATTAATTCGAGCAGAACTTGGTCAACCGGGAACATTATTAGGAGACGATCAACTTTATAATGTTATTGTTACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTCTTAGTAATACCTATAATAATTGGGGGATTTGGTAACTGATTGATTCCCCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGGCTACTACCTCCTGCCTTATTATTATTATTGTCTTCAGCTGCAGTGGAAAGAGGGGTTGGGACAGGATGAACAGTGTACCCACCTCTAGCGGGTAATATTGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCTGGAGCTTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAA?TTTTATT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Caldicochlea_globosa_A1_4         ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGGCTACTACCTCCTGCCTTATTATTATTATTGTCTTCAGCTGCAGTGGAAAGAGGGGTTGGGACAGGATGAACAGTGTACCCACCTCTAGCGGGTAATATTGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCTGGAGCTTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATACGCTGACGAGGAATGCAGCTTGAGCGCCTTCCTCTTTTCGTTTGGTCTGTAAAAATTACTGCTATTTTATTATTACTTTCATTACCTGTCTTAGCAGGAGCTATTACAATATTGTTAACTGATCGAAA
		Caldicochlea_globosa_A1_3         CTTATTAATTCGAGCAGAACTTGGTCAACCGGGAACATTATTAGGAGACGATCAACTTTATAATGTTATTGTTACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTCTTAGTAATACCTATAATAATTGGGGGATTTGGTAACTGATTGATTCCTCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGGCTACTACCTCCTGCCTTATTATTATTATTGTCTTCAGCTGCAGTGGAAAGAGGGGTTGGGACAGGATGAACAGTGTACCCACCTCTAGCGGGTAATATTGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCTGGAGCTTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATACGCTGACGAGGAATGCAGCTTGAGCGCCTTCCTCTTTTCGTTTGGTCTG?AAAAATTACTG??AATTTATTATGACTTTCAT?ACCTGTCTTAGCAGGAGCTAT?ACAATATTGTTAA?TGATCGAA?
		Caldicochlea_globosa_A1_2         CTTATTAATTCGAGCAGAACTTGGTCAACCGGGAACATTATTAGGAGACGATCAACTTTATAATGTTATTGTTACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTCTTAGTAATACCTATAATAATTGGGGGATTTGGTAACTGATTGATTCCTCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGGCTACTACCTCCTGCCTTATTATTATTATTGTCTTCAGCTGCAGTGGAAAGAGGGGTTGGGACAGGATGAACAGTGTACCCACCTCTAGCGGGTAATATTGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCTGGAGCTTCTTCTATTT?AGGTGCTGT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Caldicochlea_globosa_A1_5         CTTATTAATTCGAGCAGAACTTGGTCAACCGGGAACATTATTAGGAGACGATCAACTTTATAATGTTATTGTTACTGCACATGCTTTTGTTATAATTTTTTTCTTAGTAATACCTATAATAAT?GGGGGATTTGGTAACTGATTGATTCCTCTTATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCTCGTTTAAATAATATAAGATTTTGGCTACTACCTCCTGCCTTATTATTATTATTGTCTTCAGCTGCAGTGGAAAGAGGGGTTGGGACAGGATGAACAGTGTACCCACCTCTAGCGGGTAATATTGCTCATGCTGGAGGGTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACACCTAGCTGGAGCTTCTTCTATTTTAGGTGCTGTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATACGCTGACGAGGAATGCAGCTTGAGCGCCTTCCTCTTTTCGTTTGGTCTGTAAAAATTACTGCTATTTTATTAT?ACTTTCATTACCTGTCTTAGCAGGAGCTATTACAATATTGTTAACTGATCGAAA
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 540 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal.ext: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;