#NEXUS [written Fri Aug 16 22:09:22 CEST 2013 by Mesquite version 2.75 (build 564) at macbook-de-annick-lang.local/192.168.1.37] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=115; TAXLABELS Holomitrium_crispulum_PA29 Holomitrium_arboreum_PA17a Holomitrium_arboreum_PA17b Holomitrium_arboreum_PA18 Orthodicranum_montanum_Om Dicranum_scoparium_Ast_1011 Dicranum_scoparium_Ast_2011 Dicranum_scoparium_Ast_3011 Dicranum_scoparium_Ast_3021 Dicranum_scoparium_Ast_3031 Dicranum_scoparium_BCo_1 Dicranum_scoparium_BUL_1 Dicranum_scoparium_Cauc_1 Dicranum_scoparium_Ch_1011 Dicranum_scoparium_Ch_1061 Dicranum_scoparium_Cor_1 Dicranum_scoparium_DB_1 Dicranum_scoparium_DB_4 Dicranum_scoparium_Dis Dicranum_scoparium_Ds_04217 Dicranum_scoparium_Ds_09317 Dicranum_scoparium_Ds_09318 Dicranum_scoparium_Ds_10009 Dicranum_scoparium_FR_1 Dicranum_scoparium_Gi_1011 Dicranum_scoparium_GL_1 Dicranum_scoparium_GR_1 Dicranum_scoparium_HUN_1 Dicranum_scoparium_Is_1 Dicranum_scoparium_Is_2 Dicranum_scoparium_Is_3 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Dicranum_polysetum_Dip 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Orthodicranum_montanum_Om 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Dicranum_scoparium_FR_1 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Dicranum_fragilifolium_Dif 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Dicranum_spadiceum_Is_9 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Dicranum_lorifolium_Ru_3 1?0100?1010000000001100010000?10?1?101?0111011?11?1011??11001?1??11?110101?0?111110101??1??001?1??1??1?0??100000000101010??1?01?101 Dicranum_lorifolium_Ru_8 1?0100?1010000000001100010000?10?1?101?0111011?11?1011??11001?1??11?110101?0?111110101??1??001?1??1??1?0??100000000101010??1?01?101 Dicranum_lorifolium_Ru_4 1?0100?1010000000001100010000?10?1?101?0111011?11?1011??11001?1??11?110101?0?111110101??1??00100?11??1?0000000000001010001?1?01?101 Dicranum_lorifolium_Ru_46 1?0100?1010000000001100010000?10?1?101?0111011?11?1011??11001?1??11?110101?0?111110101??1??00100?11??1?0100000000001010001?1?01?101 Dicranum_lorifolium_Ru_44 1?0100?1010000000001100010000?10?1?101?0111011?11?1011??11001?1??11?110101?0?111110101??1??00100?11??1?0100000000001010001?1?01?101 Dicranum_lorifolium_Ru_50 1?0100?1010000000001100010000?10?1?101?0111011?11?1011??11001?1??11?110101?0?111110101??1??00100?11??1?0?10000000001010001?1?01?101 Dicranum_lorifolium_Ru_7 1?0100?1010000000001100010000?10?1?101?0111011?11?1011??11001?1??11?110101?0?111110101??1??00100?11??1?0?10000000001010001?1?01?101 Dicranum_lorifolium_Ru_35 1?0100?1010000000001100010000?10?1?101?0111011?11?1011??11001?1??11?110101?0?111110101??1??00100?11??1?0?10000000001010001?1?01?101 Dicranum_lorifolium_Ru_33 1?0100?1010000000001100010000?10?1?101?0111011?11?1011??11001?1??11?110101?0?111110101??1??00100?11??1?0?10000000001010001?1?01?101 Dicranum_lorifolium_Ru_49 1?0100?1010000000001100010000?10?1?101?0111011?11?1011??11001?1??11?110101?0?111110101??1??00100?11??1?0?10000000001010001?1?01?101 Dicranum_lorifolium_Ru_16 1?0100?1010000000001100010000?10?1?101?0111011?11?1011??11001?1??11?110101?0?111110101??1??00100?11??1?0?10000000001010001?1?01?101 Dicranum_lorifolium_Ru_6 1?0100?1010000000001100010000?10?1?101?0111011?11?1011??11001?1??11?110101?0?111110101??1??001?1??1??1?0??100000000101010??1?01?101 Dicranum_lorifolium_Ru_24 1?0100?1010000000001100010000?10?1?101?0111011?11?1011??11001?1??11?110101?0?111110101??1??00100?11??1?0?10000000001010001?1?01?101 Dicranum_lorifolium_Ru_27 ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ; END; BEGIN TREES; Title 'Dic_CPall_MB.nex.con.nex'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Holomitrium_crispulum_PA29, 2 Holomitrium_arboreum_PA17a, 3 Holomitrium_arboreum_PA17b, 4 Holomitrium_arboreum_PA18, 5 Orthodicranum_montanum_Om, 6 Dicranum_scoparium_Ast_1011, 7 Dicranum_scoparium_Ast_2011, 8 Dicranum_scoparium_Ast_3011, 9 Dicranum_scoparium_Ast_3021, 10 Dicranum_scoparium_Ast_3031, 11 Dicranum_scoparium_BCo_1, 12 Dicranum_scoparium_BUL_1, 13 Dicranum_scoparium_Cauc_1, 14 Dicranum_scoparium_Ch_1011, 15 Dicranum_scoparium_Ch_1061, 16 Dicranum_scoparium_Cor_1, 17 Dicranum_scoparium_DB_1, 18 Dicranum_scoparium_DB_4, 19 Dicranum_scoparium_Dis, 20 Dicranum_scoparium_Ds_04217, 21 Dicranum_scoparium_Ds_09317, 22 Dicranum_scoparium_Ds_09318, 23 Dicranum_scoparium_Ds_10009, 24 Dicranum_scoparium_FR_1, 25 Dicranum_scoparium_Gi_1011, 26 Dicranum_scoparium_GL_1, 27 Dicranum_scoparium_GR_1, 28 Dicranum_scoparium_HUN_1, 29 Dicranum_scoparium_Is_1, 30 Dicranum_scoparium_Is_2, 31 Dicranum_scoparium_Is_3, 32 Dicranum_scoparium_Is_4, 33 Dicranum_scoparium_Is_10, 34 Dicranum_scoparium_Ka_2031, 35 Dicranum_scoparium_L_A_1, 36 Dicranum_scoparium_MAC_1, 37 Dicranum_scoparium_Mad_1, 38 Dicranum_scoparium_Mad_2, 39 Dicranum_scoparium_Ms_04576, 40 Dicranum_scoparium_NL_1, 41 Dicranum_scoparium_NO_1, 42 Dicranum_scoparium_NO_3, 43 Dicranum_scoparium_NO_5, 44 Dicranum_scoparium_NO_6, 45 Dicranum_scoparium_Nv_1, 46 Dicranum_scoparium_Nv_2, 47 Dicranum_scoparium_Nv_3, 48 Dicranum_scoparium_Ps_1, 49 Dicranum_scoparium_PT_1, 50 Dicranum_scoparium_SE_1, 51 Dicranum_scoparium_SE_2, 52 Dicranum_scoparium_Tx_1011, 53 Dicranum_scoparium_Tx_1021, 54 Dicranum_scoparium_Tx_1031, 55 Dicranum_scoparium_Vg_2072, 56 Dicranum_scoparium_Vg_2111, 57 Dicranum_bonjeanii_FR_2, 58 Dicranum_bonjeanii_FR_4, 59 Dicranum_bonjeanii_FR_3, 60 Dicranum_bonjeanii_Nkp_1011, 61 Dicranum_bonjeanii_Vx_20314, 62 Dicranum_nipponense_Ru_5A, 63 Dicranum_nipponense_Ru_5B, 64 Dicranum_majus_Ru_1, 65 Dicranum_majus_Aleu_2, 66 Dicranum_majus_Alk_1, 67 Dicranum_majus_Attu_1, 68 Dicranum_majus_Dib, 69 Dicranum_majus_DS_4, 70 Dicranum_majus_1664, 71 Dicranum_howellii_Wa_1, 72 Dicranum_howellii_DS_5, 73 Dicranum_howellii_DH_5, 74 Dicranum_howellii_Aleu_1, 75 Dicranum_howellii_DH_3, 76 Dicranum_fuscescens_NO_4, 77 Dicranum_fuscescens_Dfus7, 78 Dicranum_fragilifolium_Dif, 79 Dicranum_polysetum_Dip, 80 Dicranum_spadiceum_Is_8, 81 Dicranum_spadiceum_Is_9, 82 Dicranum_spadiceum_Is_5, 83 Dicranum_spadiceum_Is_7, 84 Dicranum_scoparium_KR9, 85 Dicranum_scoparium_Or_1, 86 Dicranum_scoparium_BC_1, 87 Dicranum_scoparium_BC_2, 88 Dicranum_scoparium_Db_CA, 89 Dicranum_scoparium_Djap_16, 90 Dicranum_scoparium_DB_2, 91 Dicranum_scoparium_DS_1, 92 Dicranum_scoparium_DS_2, 93 Dicranum_scoparium_NB_1, 94 Dicranum_scoparium_NSc_1, 95 Dicranum_scoparium_DS_3, 96 Dicranum_japonicum_KR5, 97 Dicranum_japonicum_Djap_17, 98 Dicranum_japonicum_KR11, 99 Dicranum_japonicum_KR12, 100 Dicranum_japonicum_KR7, 101 Dicranum_japonicum_Djap_5, 102 Dicranum_lorifolium_Ru_3, 103 Dicranum_lorifolium_Ru_8, 104 Dicranum_lorifolium_Ru_4, 105 Dicranum_lorifolium_Ru_46, 106 Dicranum_lorifolium_Ru_44, 107 Dicranum_lorifolium_Ru_50, 108 Dicranum_lorifolium_Ru_7, 109 Dicranum_lorifolium_Ru_35, 110 Dicranum_lorifolium_Ru_33, 111 Dicranum_lorifolium_Ru_49, 112 Dicranum_lorifolium_Ru_16, 113 Dicranum_lorifolium_Ru_6, 114 Dicranum_lorifolium_Ru_24, 115 Dicranum_lorifolium_Ru_27; TREE 'Dic_CPall_MB' = ((1:0.004381106,(4:0.0013081253,2:0.0013499118,3:0.0012856469):0.008447138)0.978:0.06420746,(78:0.011705046,(5:0.020446265,(76:0.008732204,77:0.008103925)0.797:0.008673252,((79:0.011355961,(80:0.0010524236,81:0.0010490454,82:0.0010858986,83:0.0010784443)1.000:0.01482328,(68:0.006365606,(66:0.0027381696,67:0.0015677288,70:0.0013220067,(64:0.0010893182,65:0.0026936333,69:0.0010867409)0.957:0.0026533487)0.730:0.0027934955)1.000:0.013705304)0.878:0.005814173,(59:0.0013010192,(57:0.0013639808,58:0.0013508005)0.978:0.0032860695,((60:0.0011043634,61:0.0026522602)0.973:0.0035789013,(71:0.0017148297,72:0.0010609577,73:0.0010928733,74:0.0021368884,75:0.0018325244)1.000:0.012746114)0.540:0.0026086727,(((85:0.0026530083,87:0.004495419)0.541:0.0039872797,(8:0.0010783083,9:0.0010814226,10:0.0010935876,11:0.0010851991,12:0.0010931689,13:0.0011006542,14:0.0011879189,16:0.0010725686,17:0.0011010404,18:0.0010806973,19:0.0029099665,20:0.0010630297,21:0.0029087265,22:0.0010460116,23:0.0010888312,25:0.002598072,26:0.0015645869,27:0.0010808265,28:0.0011044663,29:0.0010749785,30:0.0010857063,31:0.0010607829,32:0.0010698139,33:0.0026495547,34:0.0010727729,35:0.0015317338,36:0.0010781377,37:0.0026077293,38:0.0021684985,39:0.009184949,40:0.0029316172,41:0.0010720547,42:0.0026744695,43:0.009780015,44:0.0010756535,45:0.0010599283,46:0.0010757232,47:0.001088995,48:0.0015422894,49:0.001495964,50:0.0010756211,51:0.0010860455,52:0.0010601373,53:0.0010437326,54:0.0010700966,55:0.0010537127,86:0.0042898576,88:0.0033523403,(6:0.0010543313,7:0.0010574029)0.868:0.0075354744,(15:0.0011066279,24:0.0026367258,56:0.00260292,84:0.00265991,89:0.0026486465)0.524:0.0025681013)0.594:0.0055020484)1.000:0.012160892,((62:0.0010715142,63:0.001081218)1.000:0.009995051,(90:0.004872366,91:0.0010895652,94:0.003430598,95:0.0042407126,(92:0.0014623204,93:0.007830158)0.703:0.006509512,(96:0.0013135846,97:0.0017321883,98:0.0013104607,99:0.0013065593,100:0.0011907556,101:0.0013059858)0.977:0.0044689244,(102:0.0021806608,103:0.00136459,104:0.0011082392,105:0.0017643581,106:0.00773033,107:0.0013271538,108:0.0013425848,109:0.0013109182,110:0.0017727466,111:0.0049528587,112:0.0030434083,113:0.0021348076,114:0.0013438255,115:0.0013884493)1.000:0.007470446)0.999:0.009234688)0.648:0.0031347163)0.914:0.0045822775)0.999:0.009413421)0.651:0.0047117514)0.519:0.007027622)1.000:0.020699255); END; BEGIN MESQUITECHARMODELS; ProbModelSet * UNTITLED (CHARACTERS = 'Dic_CPall_DNA') = 'Jukes-Cantor': 1 - 1902; ProbModelSet * UNTITLED (CHARACTERS = 'Dic_CPall_indels') = 'Mk1 (est.)': 1 - 10; ProbModelSet * UNTITLED (CHARACTERS = 'Dic_ITS_DNA') = 'Jukes-Cantor': 1 - 1091; ProbModelSet * UNTITLED (CHARACTERS = 'Dic_ITS_indels') = 'Mk1 (est.)': 1 - 131; END; BEGIN CODONS; CODESET * UNTITLED (CHARACTERS = 'Dic_CPall_DNA') = universal: 1 - 1902; CODESET * UNTITLED (CHARACTERS = 'Dic_ITS_DNA') = universal: 1 - 1091; END; BEGIN ASSUMPTIONS; TYPESET * UNTITLED (CHARACTERS = 'Dic_CPall_DNA') = unord: 1 - 1902; TYPESET * UNTITLED (CHARACTERS = 'Dic_CPall_indels') = unord: 1 - 10; TYPESET * UNTITLED (CHARACTERS = 'Dic_ITS_DNA') = unord: 1 - 1091; TYPESET * UNTITLED (CHARACTERS = 'Dic_ITS_indels') = unord: 1 - 131; END; BEGIN TREES; Title 'Dic_CPall_MLsic.nex'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Holomitrium_crispulum_PA29, 2 Holomitrium_arboreum_PA17a, 3 Holomitrium_arboreum_PA17b, 4 Holomitrium_arboreum_PA18, 5 Orthodicranum_montanum_Om, 6 Dicranum_scoparium_Ast_1011, 7 Dicranum_scoparium_Ast_2011, 8 Dicranum_scoparium_Ast_3011, 9 Dicranum_scoparium_Ast_3021, 10 Dicranum_scoparium_Ast_3031, 11 Dicranum_scoparium_BCo_1, 12 Dicranum_scoparium_BUL_1, 13 Dicranum_scoparium_Cauc_1, 14 Dicranum_scoparium_Ch_1011, 15 Dicranum_scoparium_Ch_1061, 16 Dicranum_scoparium_Cor_1, 17 Dicranum_scoparium_DB_1, 18 Dicranum_scoparium_DB_4, 19 Dicranum_scoparium_Dis, 20 Dicranum_scoparium_Ds_04217, 21 Dicranum_scoparium_Ds_09317, 22 Dicranum_scoparium_Ds_09318, 23 Dicranum_scoparium_Ds_10009, 24 Dicranum_scoparium_FR_1, 25 Dicranum_scoparium_Gi_1011, 26 Dicranum_scoparium_GL_1, 27 Dicranum_scoparium_GR_1, 28 Dicranum_scoparium_HUN_1, 29 Dicranum_scoparium_Is_1, 30 Dicranum_scoparium_Is_2, 31 Dicranum_scoparium_Is_3, 32 Dicranum_scoparium_Is_4, 33 Dicranum_scoparium_Is_10, 34 Dicranum_scoparium_Ka_2031, 35 Dicranum_scoparium_L_A_1, 36 Dicranum_scoparium_MAC_1, 37 Dicranum_scoparium_Mad_1, 38 Dicranum_scoparium_Mad_2, 39 Dicranum_scoparium_Ms_04576, 40 Dicranum_scoparium_NL_1, 41 Dicranum_scoparium_NO_1, 42 Dicranum_scoparium_NO_3, 43 Dicranum_scoparium_NO_5, 44 Dicranum_scoparium_NO_6, 45 Dicranum_scoparium_Nv_1, 46 Dicranum_scoparium_Nv_2, 47 Dicranum_scoparium_Nv_3, 48 Dicranum_scoparium_Ps_1, 49 Dicranum_scoparium_PT_1, 50 Dicranum_scoparium_SE_1, 51 Dicranum_scoparium_SE_2, 52 Dicranum_scoparium_Tx_1011, 53 Dicranum_scoparium_Tx_1021, 54 Dicranum_scoparium_Tx_1031, 55 Dicranum_scoparium_Vg_2072, 56 Dicranum_scoparium_Vg_2111, 57 Dicranum_bonjeanii_FR_2, 58 Dicranum_bonjeanii_FR_4, 59 Dicranum_bonjeanii_FR_3, 60 Dicranum_bonjeanii_Nkp_1011, 61 Dicranum_bonjeanii_Vx_20314, 62 Dicranum_nipponense_Ru_5A, 63 Dicranum_nipponense_Ru_5B, 64 Dicranum_majus_Ru_1, 65 Dicranum_majus_Aleu_2, 66 Dicranum_majus_Alk_1, 67 Dicranum_majus_Attu_1, 68 Dicranum_majus_Dib, 69 Dicranum_majus_DS_4, 70 Dicranum_majus_1664, 71 Dicranum_howellii_Wa_1, 72 Dicranum_howellii_DS_5, 73 Dicranum_howellii_DH_5, 74 Dicranum_howellii_Aleu_1, 75 Dicranum_howellii_DH_3, 76 Dicranum_fuscescens_NO_4, 77 Dicranum_fuscescens_Dfus7, 78 Dicranum_fragilifolium_Dif, 79 Dicranum_polysetum_Dip, 80 Dicranum_spadiceum_Is_8, 81 Dicranum_spadiceum_Is_9, 82 Dicranum_spadiceum_Is_5, 83 Dicranum_spadiceum_Is_7, 84 Dicranum_scoparium_KR9, 85 Dicranum_scoparium_Or_1, 86 Dicranum_scoparium_BC_1, 87 Dicranum_scoparium_BC_2, 88 Dicranum_scoparium_Db_CA, 89 Dicranum_scoparium_Djap_16, 90 Dicranum_scoparium_DB_2, 91 Dicranum_scoparium_DS_1, 92 Dicranum_scoparium_DS_2, 93 Dicranum_scoparium_NB_1, 94 Dicranum_scoparium_NSc_1, 95 Dicranum_scoparium_DS_3, 96 Dicranum_japonicum_KR5, 97 Dicranum_japonicum_Djap_17, 98 Dicranum_japonicum_KR11, 99 Dicranum_japonicum_KR12, 100 Dicranum_japonicum_KR7, 101 Dicranum_japonicum_Djap_5, 102 Dicranum_lorifolium_Ru_3, 103 Dicranum_lorifolium_Ru_8, 104 Dicranum_lorifolium_Ru_4, 105 Dicranum_lorifolium_Ru_46, 106 Dicranum_lorifolium_Ru_44, 107 Dicranum_lorifolium_Ru_50, 108 Dicranum_lorifolium_Ru_7, 109 Dicranum_lorifolium_Ru_35, 110 Dicranum_lorifolium_Ru_33, 111 Dicranum_lorifolium_Ru_49, 112 Dicranum_lorifolium_Ru_16, 113 Dicranum_lorifolium_Ru_6, 114 Dicranum_lorifolium_Ru_24, 115 Dicranum_lorifolium_Ru_27; TREE 'Dic_CPall_ML' = ((1:7.8509835E-4,(4:9.0587014E-7,3:1.81174028E-6,2:1.81174028E-6)100:0.0031167378)100:0.45774674,(78:0.0028818136,((5:0.0066590267,(77:0.0022584475,76:0.0023436754)54:0.0025012074)26:9.0587014E-7,((79:0.0036522248,(82:9.0587014E-7,80:1.81174028E-6,81:2.71761042E-6,83:2.71761042E-6)100:0.00539419207014,(68:0.0018001134,(66:6.1000674E-4,67:1.81174028E-6,70:2.71761042E-6,(65:6.0655124E-4,64:1.81174028E-6,69:1.81174028E-6)64:5.9435174028E-4)58:5.8673474E-4)96:0.0042487472701399995)27:0.001784339,(59:9.0587014E-7,((58:9.0587014E-7,57:9.0587014E-7)78:7.1971695E-4,((71:9.0587014E-7,75:3.2384868140000006E-5,(74:9.0587014E-7,73:1.81174028E-6,72:1.81174028E-6)33:5.924991579999999E-4)97:0.004192137,(61:5.8633776E-4,60:9.0587014E-7)81:0.0011841356701400001,(((63:9.0587014E-7,62:9.0587014E-7)99:0.0030022627,(((92:9.0587014E-7,93:0.002564988)95:0.0023620725,(100:9.0587014E-7,97:1.81174028E-6,98:3.62348056E-6,96:3.62348056E-6,101:3.62348056E-6,99:3.62348056E-6)83:0.0012966066)35:6.430057E-4,(91:1.81174028E-6,94:2.71761042E-6,95:9.226957002800001E-4,90:0.00177353060028,(110:1.81174028E-6,115:2.71761042E-6,105:9.19942822E-6,112:7.1878482808E-4,104:1.81174028E-6,103:3.62348056E-6,114:4.5293507E-6,108:4.5293507E-6,107:3.62348056E-6,109:4.5293507000000005E-6,102:5.43522084E-6,106:0.00305574272084,111:0.00148772899098,113:7.24696112E-6)95:0.0023658595)31:9.0587014E-7)83:0.0033189363)46:6.0950744E-4,((87:8.99049E-4,85:9.0587014E-7)63:7.1328063E-4,(48:9.0587014E-7,26:1.81174028E-6,35:2.71761042E-6,86:9.2397043242E-4,((39:0.00294531317014,21:5.8659683014E-4,19:5.8673693014E-4,40:5.953497701400001E-4)41:5.835963E-4,38:2.71761042E-6,49:3.62348056E-6,((7:9.0587014E-7,6:9.0587014E-7)100:0.0027730723,(37:9.0587014E-7,42:1.81174028E-6,43:0.0023106128701399996)33:0.001753504)27:1.7370304042000002E-4,29:2.71761042E-6,32:3.62348056E-6,20:5.43522084E-6,46:7.24696112E-6,45:7.24696112E-6,34:8.15283126E-6,41:8.15283126E-6,52:8.15283126E-6,50:8.15283126E-6,53:6.34109098E-6,31:6.34109098E-6,22:7.24696112E-6,55:7.24696112E-6,44:8.15283126E-6,54:8.15283126E-6,18:8.15283126E-6,16:8.15283126E-6)8:5.8565448242E-4,33:5.8991408056E-4,14:5.43522084E-6,28:6.34109098E-6,27:7.24696112E-6,47:8.15283126E-6,11:9.0587014E-6,23:9.964571539999999E-6,8:1.0870441679999999E-5,30:1.177631182E-5,10:1.268218196E-5,12:1.35880521E-5,9:1.449392224E-5,13:1.539979238E-5,51:1.630566252E-5,36:1.721153266E-5,25:6.037990428000001E-4,88:1.902327294E-5,17:1.902327294E-5,(84:5.8562215E-4,15:1.81174028E-6,89:5.891489802799999E-4,24:5.8985731042E-4,56:5.8673201042E-4)50:6.062092528000005E-4)31:0.0017727887)69:0.0035912804)62:0.00118650857014)22:5.84423E-4)22:2.8032573E-6)75:0.0024273514)19:0.0017552482)47:0.002468194)100:0.44225326); END; BEGIN TREES; Title 'Dic_ITS_MB.nex.con.nex'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Holomitrium_crispulum_PA29, 2 Holomitrium_arboreum_PA17a, 3 Holomitrium_arboreum_PA17b, 4 Holomitrium_arboreum_PA18, 5 Orthodicranum_montanum_Om, 6 Dicranum_scoparium_Ast_1011, 7 Dicranum_scoparium_Ast_2011, 8 Dicranum_scoparium_Ast_3011, 9 Dicranum_scoparium_Ast_3021, 10 Dicranum_scoparium_Ast_3031, 11 Dicranum_scoparium_BCo_1, 12 Dicranum_scoparium_BUL_1, 13 Dicranum_scoparium_Cauc_1, 14 Dicranum_scoparium_Ch_1011, 15 Dicranum_scoparium_Ch_1061, 16 Dicranum_scoparium_Cor_1, 17 Dicranum_scoparium_DB_1, 18 Dicranum_scoparium_DB_4, 19 Dicranum_scoparium_Dis, 20 Dicranum_scoparium_Ds_04217, 21 Dicranum_scoparium_Ds_09317, 22 Dicranum_scoparium_Ds_09318, 23 Dicranum_scoparium_Ds_10009, 24 Dicranum_scoparium_FR_1, 25 Dicranum_scoparium_Gi_1011, 26 Dicranum_scoparium_GL_1, 27 Dicranum_scoparium_GR_1, 28 Dicranum_scoparium_HUN_1, 29 Dicranum_scoparium_Is_1, 30 Dicranum_scoparium_Is_2, 31 Dicranum_scoparium_Is_3, 32 Dicranum_scoparium_Is_4, 33 Dicranum_scoparium_Is_10, 34 Dicranum_scoparium_Ka_2031, 35 Dicranum_scoparium_L_A_1, 36 Dicranum_scoparium_MAC_1, 37 Dicranum_scoparium_Mad_1, 38 Dicranum_scoparium_Mad_2, 39 Dicranum_scoparium_Ms_04576, 40 Dicranum_scoparium_NL_1, 41 Dicranum_scoparium_NO_1, 42 Dicranum_scoparium_NO_3, 43 Dicranum_scoparium_NO_5, 44 Dicranum_scoparium_NO_6, 45 Dicranum_scoparium_Nv_1, 46 Dicranum_scoparium_Nv_2, 47 Dicranum_scoparium_Nv_3, 48 Dicranum_scoparium_Ps_1, 49 Dicranum_scoparium_PT_1, 50 Dicranum_scoparium_SE_1, 51 Dicranum_scoparium_SE_2, 52 Dicranum_scoparium_Tx_1011, 53 Dicranum_scoparium_Tx_1021, 54 Dicranum_scoparium_Tx_1031, 55 Dicranum_scoparium_Vg_2072, 56 Dicranum_scoparium_Vg_2111, 57 Dicranum_bonjeanii_FR_2, 58 Dicranum_bonjeanii_FR_4, 59 Dicranum_bonjeanii_FR_3, 60 Dicranum_bonjeanii_Nkp_1011, 61 Dicranum_bonjeanii_Vx_20314, 62 Dicranum_nipponense_Ru_5A, 63 Dicranum_nipponense_Ru_5B, 64 Dicranum_majus_Ru_1, 65 Dicranum_majus_Aleu_2, 66 Dicranum_majus_Alk_1, 67 Dicranum_majus_Attu_1, 68 Dicranum_majus_Dib, 69 Dicranum_majus_DS_4, 70 Dicranum_majus_1664, 71 Dicranum_howellii_Wa_1, 72 Dicranum_howellii_DS_5, 73 Dicranum_howellii_DH_5, 111 Dicranum_howellii_Aleu_1, 74 Dicranum_howellii_DH_3, 75 Dicranum_fuscescens_NO_4, 76 Dicranum_fuscescens_Dfus7, 77 Dicranum_fragilifolium_Dif, 78 Dicranum_polysetum_Dip, 79 Dicranum_spadiceum_Is_8, 80 Dicranum_spadiceum_Is_9, 81 Dicranum_spadiceum_Is_5, 82 Dicranum_spadiceum_Is_7, 83 Dicranum_scoparium_KR9, 84 Dicranum_scoparium_Or_1, 85 Dicranum_scoparium_BC_1, 86 Dicranum_scoparium_BC_2, 87 Dicranum_scoparium_Db_CA, 112 Dicranum_scoparium_Djap_16, 88 Dicranum_scoparium_DB_2, 89 Dicranum_scoparium_DS_1, 90 Dicranum_scoparium_DS_2, 113 Dicranum_scoparium_NB_1, 91 Dicranum_scoparium_NSc_1, 92 Dicranum_scoparium_DS_3, 93 Dicranum_japonicum_KR5, 94 Dicranum_japonicum_Djap_17, 95 Dicranum_japonicum_KR11, 96 Dicranum_japonicum_KR12, 97 Dicranum_japonicum_KR7, 114 Dicranum_japonicum_Djap_5, 98 Dicranum_lorifolium_Ru_3, 99 Dicranum_lorifolium_Ru_8, 100 Dicranum_lorifolium_Ru_4, 101 Dicranum_lorifolium_Ru_46, 102 Dicranum_lorifolium_Ru_44, 103 Dicranum_lorifolium_Ru_50, 104 Dicranum_lorifolium_Ru_7, 105 Dicranum_lorifolium_Ru_35, 106 Dicranum_lorifolium_Ru_33, 107 Dicranum_lorifolium_Ru_49, 108 Dicranum_lorifolium_Ru_16, 109 Dicranum_lorifolium_Ru_6, 110 Dicranum_lorifolium_Ru_24, 115 Dicranum_lorifolium_Ru_27; TREE 'Dic_ITS_MB' = ((1:0.10784374,(4:8.7325927E-4,2:9.017075E-4,3:9.010619E-4):0.10004894)1.000:0.15951832,(5:0.033338986,(77:0.005454351,78:0.022746162)0.585:0.0052035665,(64:0.0010019322,65:0.0024413078,(66:0.0010020339,67:0.0023979498,68:0.0024946486,69:0.002383723,70:9.88743E-4)0.949:0.0024216985)0.951:0.0024579887,((75:0.0038251006,76:0.0038333947)0.987:0.005826086,(79:9.482389E-4,80:0.0022910489,(81:9.896401E-4,82:0.0037646242)0.915:0.0022860935)0.999:0.055318523)0.971:0.011446772,(94:0.0053609908,(6:0.0010092418,7:9.870474E-4,8:0.0010117317,11:0.0025064207,12:9.951832E-4,13:0.0010029492,14:0.0010273843,15:0.0010057782,16:0.0010164373,17:0.013750128,18:9.994796E-4,20:0.0010281341,21:0.001018326,22:0.0010057092,23:0.0010001102,24:0.0010421219,25:0.001016194,26:0.001010241,27:0.0010175721,28:0.0010075822,29:0.0010262459,30:9.927012E-4,31:0.0010128185,32:9.83632E-4,33:0.0010314181,35:0.0010491243,36:0.0010571775,37:0.0010286074,38:9.950527E-4,39:9.945694E-4,40:0.0010140188,41:0.001008615,42:0.0010062724,43:9.866607E-4,44:9.885264E-4,45:0.0010156693,46:0.001002592,47:9.934129E-4,48:0.0010346391,49:9.864331E-4,50:0.0010015707,51:0.0010093002,52:9.972284E-4,53:0.0010086453,54:0.0010052638,55:0.0010172778,56:0.0010115991,57:0.001002655,58:0.0010088119,59:0.0013444012,60:0.0010097931,61:0.0010227136,83:0.001001436,85:0.0010020221,87:0.0010171393,88:0.0036154182,89:0.0010171296,90:0.0024217898,91:0.0071768123,92:0.0010150848,93:0.0051225186,98:0.0010432958,(9:0.0010595096,10:0.0010796923)0.953:0.0024448086,(19:0.0024152563,34:0.0010023684)0.996:0.0038921987,(62:9.801128E-4,63:9.957372E-4)1.000:0.011128052,(84:0.0018501792,86:0.0010162545)0.993:0.0037961283,(99:0.0010202649,109:0.0010092325)0.900:0.0023826477,(71:0.0010008581,72:9.908172E-4,(73:0.0024170752,74:9.987692E-4)0.827:0.0022004277)0.732:0.0023352378,(97:0.004184139,((95:0.0010028268,96:0.0010108224)0.986:0.002580526,(103:9.748406E-4,104:9.838782E-4,105:9.6594176E-4,106:9.863575E-4,107:9.7230397E-4,108:9.794504E-4,110:9.6092385E-4,(100:0.0019436629,(101:0.003915026,102:0.0010170562)0.547:0.001912329)0.786:0.0023314296)0.718:0.002476313)0.795:0.0027346644)0.827:0.002831353)0.830:0.0070108003)0.830:0.006705879)1.000:0.19454604); 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TREE 'Dic_ITS_ML' = ((1:0.16423063,(2:3.1223118E-7,3:6.2446236E-7,4:6.2446236E-7)100:0.11429035)100:0.4163795,((80:0.0013973243,79:6.2446236E-7,(81:3.1223118E-7,82:0.00278517)41:0.0013825746311799999)93:0.022819785,((75:0.0028732151,76:0.0029153528)99:0.009101399,((77:0.0058235615,78:0.029051408)33:0.0043871324,((5:0.03775227,(65:0.00145169923118,64:6.2446236E-7,68:0.0029453726999999997,(69:0.00144865363118,67:0.00145313073118,66:6.2446236E-7,70:6.2446236E-7)30:0.00145295723118)78:0.0015426087)69:0.0013654525,(94:0.0044368277,((71:6.2446236E-7,72:6.2446236E-7,(73:0.0014290451,74:3.1223118E-7)49:0.0014279941)44:0.0014324262,(62:3.1223118E-7,63:3.1223118E-7)100:0.010198989231179999,((93:0.004392543,92:9.366935399999999E-7,89:9.366935399999999E-7,88:0.00295536286236,91:0.005606765462360001)12:0.0014639085,90:0.00147668856236,(58:3.1223118E-7,60:6.2446236E-7,57:9.366935399999999E-7,61:1.24892472E-6,(59:3.1223118E-7,((99:3.1223118E-7,109:3.1223118E-7)63:0.0014540063,98:6.2446236E-7,(97:0.0029853212,((96:3.1223118E-7,95:3.1223118E-7)75:0.0014364247,((100:3.1223118E-7,(101:0.0028488059,102:3.1223118E-7)55:0.0014156691)42:0.0014270237,110:9.366935399999999E-7,104:9.366935399999999E-7,107:9.366935399999999E-7,108:1.24892472E-6,106:1.5611558999999999E-6,105:1.8733870799999999E-6,103:1.8733870799999999E-6)31:0.0014277002)40:0.0015941954)52:0.00162419093118)12:0.0016106174)12:0.00160578139354)18:0.0032368254623600006,((10:3.1223118E-7,9:3.1223118E-7)65:0.0014575521,(48:3.1223118E-7,33:6.2446236E-7,35:9.366935399999999E-7,11:0.00145061329354,17:0.01365736669354)14:0.00145504243118,(86:3.1223118E-7,84:3.1223118E-7)83:0.00291818476236,(42:3.1223118E-7,47:6.2446236E-7,7:9.366935399999999E-7,18:1.24892472E-6,13:1.5611558999999999E-6,53:1.8733870799999999E-6,32:2.1856182599999996E-6,20:2.49784944E-6,46:2.81008062E-6,28:3.1223118E-6,22:3.4345429800000004E-6,29:3.7467741600000006E-6,31:4.059005340000001E-6,39:4.371236520000001E-6,26:4.683467700000001E-6,27:4.995698880000001E-6,15:5.3079300600000015E-6,36:5.620161240000002E-6,37:5.932392420000001E-6,23:6.244623600000001E-6,45:6.556854780000001E-6,41:6.869085960000002E-6,54:7.181317140000001E-6,40:7.493548320000001E-6,56:7.805779500000001E-6,24:8.118010680000002E-6,55:8.430241860000002E-6,49:8.742473040000002E-6,44:9.05470422E-6,50:9.3669354E-6,21:9.67916658E-6,51:9.991397760000001E-6,85:1.0303628940000001E-5,43:1.0615860120000001E-5,52:1.0928091300000002E-5,83:1.1240322480000002E-5,8:1.1552553660000002E-5,14:1.1864784840000002E-5,6:1.2177016020000002E-5,16:1.2489247200000002E-5,12:1.2801478380000003E-5,30:1.3113709560000003E-5,87:1.3425940740000003E-5,25:1.3738171920000003E-5,38:1.4050403100000003E-5,(34:3.1223118E-7,19:0.0014480152)92:0.00296789877192)3:9.366935399999999E-7)18:0.00146199553118)15:0.00162840773118)80:0.0058195232)81:0.005891042)60:0.002205668)19:0.0099843405)68:0.045681916)100:0.4836204); END; BEGIN TREES; Title 'Dic_MB.nex.con.nex'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Holomitrium_crispulum_PA29, 2 Holomitrium_arboreum_PA17a, 3 Holomitrium_arboreum_PA17b, 4 Holomitrium_arboreum_PA18, 5 Orthodicranum_montanum_Om, 6 Dicranum_scoparium_Ast_1011, 7 Dicranum_scoparium_Ast_2011, 8 Dicranum_scoparium_Ast_3011, 9 Dicranum_scoparium_Ast_3021, 10 Dicranum_scoparium_Ast_3031, 11 Dicranum_scoparium_BCo_1, 12 Dicranum_scoparium_BUL_1, 13 Dicranum_scoparium_Cauc_1, 14 Dicranum_scoparium_Ch_1011, 15 Dicranum_scoparium_Ch_1061, 16 Dicranum_scoparium_Cor_1, 17 Dicranum_scoparium_DB_1, 18 Dicranum_scoparium_DB_4, 19 Dicranum_scoparium_Dis, 20 Dicranum_scoparium_Ds_04217, 21 Dicranum_scoparium_Ds_09317, 22 Dicranum_scoparium_Ds_09318, 23 Dicranum_scoparium_Ds_10009, 24 Dicranum_scoparium_FR_1, 25 Dicranum_scoparium_Gi_1011, 26 Dicranum_scoparium_GL_1, 27 Dicranum_scoparium_GR_1, 28 Dicranum_scoparium_HUN_1, 29 Dicranum_scoparium_Is_1, 30 Dicranum_scoparium_Is_2, 31 Dicranum_scoparium_Is_3, 32 Dicranum_scoparium_Is_4, 33 Dicranum_scoparium_Is_10, 34 Dicranum_scoparium_Ka_2031, 35 Dicranum_scoparium_L_A_1, 36 Dicranum_scoparium_MAC_1, 37 Dicranum_scoparium_Mad_1, 38 Dicranum_scoparium_Mad_2, 39 Dicranum_scoparium_Ms_04576, 40 Dicranum_scoparium_NL_1, 41 Dicranum_scoparium_NO_1, 42 Dicranum_scoparium_NO_3, 43 Dicranum_scoparium_NO_5, 44 Dicranum_scoparium_NO_6, 45 Dicranum_scoparium_Nv_1, 46 Dicranum_scoparium_Nv_2, 47 Dicranum_scoparium_Nv_3, 48 Dicranum_scoparium_Ps_1, 49 Dicranum_scoparium_PT_1, 50 Dicranum_scoparium_SE_1, 51 Dicranum_scoparium_SE_2, 52 Dicranum_scoparium_Tx_1011, 53 Dicranum_scoparium_Tx_1021, 54 Dicranum_scoparium_Tx_1031, 55 Dicranum_scoparium_Vg_2072, 56 Dicranum_scoparium_Vg_2111, 57 Dicranum_bonjeanii_FR_2, 58 Dicranum_bonjeanii_FR_4, 59 Dicranum_bonjeanii_FR_3, 60 Dicranum_bonjeanii_Nkp_1011, 61 Dicranum_bonjeanii_Vx_20314, 62 Dicranum_nipponense_Ru_5A, 63 Dicranum_nipponense_Ru_5B, 64 Dicranum_majus_Ru_1, 65 Dicranum_majus_Aleu_2, 66 Dicranum_majus_Alk_1, 67 Dicranum_majus_Attu_1, 68 Dicranum_majus_Dib, 69 Dicranum_majus_DS_4, 70 Dicranum_majus_1664, 71 Dicranum_howellii_Wa_1, 72 Dicranum_howellii_DS_5, 73 Dicranum_howellii_DH_5, 74 Dicranum_howellii_Aleu_1, 75 Dicranum_howellii_DH_3, 76 Dicranum_fuscescens_NO_4, 77 Dicranum_fuscescens_Dfus7, 78 Dicranum_fragilifolium_Dif, 79 Dicranum_polysetum_Dip, 80 Dicranum_spadiceum_Is_8, 81 Dicranum_spadiceum_Is_9, 82 Dicranum_spadiceum_Is_5, 83 Dicranum_spadiceum_Is_7, 84 Dicranum_scoparium_KR9, 85 Dicranum_scoparium_Or_1, 86 Dicranum_scoparium_BC_1, 87 Dicranum_scoparium_BC_2, 88 Dicranum_scoparium_Db_CA, 89 Dicranum_scoparium_Djap_16, 90 Dicranum_scoparium_DB_2, 91 Dicranum_scoparium_DS_1, 92 Dicranum_scoparium_DS_2, 93 Dicranum_scoparium_NB_1, 94 Dicranum_scoparium_NSc_1, 95 Dicranum_scoparium_DS_3, 96 Dicranum_japonicum_KR5, 97 Dicranum_japonicum_Djap_17, 98 Dicranum_japonicum_KR11, 99 Dicranum_japonicum_KR12, 100 Dicranum_japonicum_KR7, 101 Dicranum_japonicum_Djap_5, 102 Dicranum_lorifolium_Ru_3, 103 Dicranum_lorifolium_Ru_8, 104 Dicranum_lorifolium_Ru_4, 105 Dicranum_lorifolium_Ru_46, 106 Dicranum_lorifolium_Ru_44, 107 Dicranum_lorifolium_Ru_50, 108 Dicranum_lorifolium_Ru_7, 109 Dicranum_lorifolium_Ru_35, 110 Dicranum_lorifolium_Ru_33, 111 Dicranum_lorifolium_Ru_49, 112 Dicranum_lorifolium_Ru_16, 113 Dicranum_lorifolium_Ru_6, 114 Dicranum_lorifolium_Ru_24, 115 Dicranum_lorifolium_Ru_27; TREE 'Dic_COMBI_MB' = ((1:0.034837406,(4:3.2985184E-4,2:3.241654E-4,3:3.2580656E-4):0.03320933)1.000:0.04941668,(((80:3.1164134E-4,81:7.5567217E-4)0.594:5.938146E-4,(82:3.090698E-4,83:0.0012025108)0.722:6.6359085E-4)1.000:0.016522434,(78:0.005925499,79:0.013012759,(5:0.017485842,(76:0.0027226866,77:0.0019331377)1.000:0.00808505,((64:3.1995238E-4,65:0.0012167322,(69:7.8121317E-4,(66:7.7394256E-4,67:8.826879E-4,68:0.002619331,70:3.4684603E-4)0.977:7.655118E-4)0.957:7.716282E-4)1.000:0.0051660924,((71:3.2203886E-4,(72:3.1566495E-4,(74:9.450842E-4,(73:7.032443E-4,75:3.8936076E-4)0.553:6.4334815E-4)0.701:6.604242E-4)0.983:7.499007E-4)1.000:0.004040014,((59:0.0011544882,(57:3.4440984E-4,58:3.3984243E-4)0.989:8.2774955E-4,(60:3.1782975E-4,61:7.631113E-4)1.000:0.0012259473)0.996:0.0013090187,(((85:6.1763136E-4,87:9.4637106E-4)0.999:0.0018524716,(8:3.179279E-4,12:3.1845891E-4,13:3.2130815E-4,14:3.361941E-4,16:3.159634E-4,18:3.1931145E-4,20:3.1214245E-4,22:3.1554676E-4,23:3.1991696E-4,25:7.561756E-4,26:3.639719E-4,27:3.163393E-4,28:3.2072922E-4,29:3.198048E-4,30:3.1981408E-4,31:3.1560234E-4,32:3.175915E-4,36:3.1210028E-4,38:4.1173972E-4,41:3.214056E-4,44:3.1981006E-4,45:3.1849832E-4,46:3.1689435E-4,47:3.17236E-4,49:3.6688757E-4,50:3.1722878E-4,51:3.2500463E-4,52:3.1705067E-4,53:3.1410911E-4,54:3.2067098E-4,55:3.1564903E-4,86:9.272646E-4,88:4.5157754E-4,(6:3.1772902E-4,7:3.1668862E-4)0.873:0.0022218353,(9:3.1456555E-4,10:3.2447296E-4)0.986:7.659488E-4,(11:7.6975394E-4,17:0.0028972887,33:7.7847857E-4,35:3.6289566E-4,48:3.5726675E-4)0.873:7.6056435E-4,(15:3.2346678E-4,24:7.810565E-4,56:7.690001E-4,84:7.6964067E-4,89:0.0014142859)0.717:7.6532E-4,(19:0.001655985,34:3.2768937E-4)0.993:0.0012245709,(21:7.946854E-4,39:0.0026541147,40:8.0567616E-4)0.728:7.7005214E-4,(37:3.9900412E-4,42:4.209689E-4,43:0.0015944543)0.890:0.0012553786)0.793:0.0015935568)1.000:0.0038422162,((62:3.0977954E-4,63:3.1258777E-4)1.000:0.006277078,((90:0.002174991,91:3.154916E-4,95:9.1354636E-4)0.638:8.378658E-4,(94:0.0021031005,(92:4.3457942E-4,93:0.0034010634)0.574:0.0024075664)0.577:0.0024456969,(96:0.0017428654,97:0.0036317077,101:6.609209E-4,(100:0.0013129144,(98:3.3769844E-4,99:3.4315648E-4)0.909:0.001393356)0.618:0.0014922866)0.596:0.0011525546,(102:3.968252E-4,(103:3.4151948E-4,113:4.0400465E-4)0.933:8.157072E-4,(107:3.4066598E-4,108:3.3655184E-4,109:3.3987145E-4,110:3.794074E-4,111:0.0013484857,112:7.7821483E-4,114:3.434908E-4,115:6.8605173E-4,(104:5.508528E-4,(105:0.0014304369,106:0.0023419587)0.571:6.9060194E-4)0.698:7.57028E-4)0.787:0.0015776419)1.000:0.0027084402)0.999:0.00255989)0.713:9.1433455E-4)0.977:0.0014001689)0.642:8.1997574E-4)1.000:0.006390432)0.896:0.002187983)0.628:0.0025136755)0.789:0.010151888)1.000:0.049061418); 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