#NEXUS BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep13816; DIMENSIONS NTAX=31; TAXLABELS Blakeslea_sinensis_CBS_564.91 Blakeslea_trispora_CBS_130.59 Blakeslea_trispora_CBS_137.49 Blakeslea_trispora_CBS_198.80 Choanephora_cucurbitarum_CBS_120.25 Choanephora_cucurbitarum_CBS_150.51 Choanephora_cucurbitarum_CBS_178.76 Choanephora_cucurbitarum_CBS_445.72 Choanephora_cucurbitarum_CBS_674.93 Choanephora_infundibulifera_CBS_153.51 Choanephora_infundibulifera_CBS_155.51 Choanephora_infundibulifera_CBS_155.58 Gilbertella_hainanensis_CBS_565.91 Gilbertella_persicaria_CBS_190.32 Gilbertella_persicaria_CBS_246.59 Gilbertella_persicaria_CBS_325.71D Gilbertella_persicaria_CBS_325.71a Gilbertella_persicaria_CBS_403.51 Gilbertella_persicaria_CBS_421.77 Gilbertella_persicaria_CBS_442.64 Gilbertella_persicaria_CBS_532.77 Gilbertella_persicaria_CBS_785.97 Gilbertella_persicaria_COAD1728 Hyphomucor_assamensis_CBS_415.77 Mucor_fuscus_CBS_230.29 Mucor_fuscus_CBS_254.48 Mucor_fuscus_CBS_282.78 Mucor_fuscus_CBS_313.78 Mucor_fuscus_CBS_530.77 Poitrasia_circinans_CBS_153.58 Poitrasia_circinans_CBS_647.70 ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE Gilbertella_persicaria_and_related_taxa_ITS; DIMENSIONS NCHAR=579; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX Blakeslea_sinensis_CBS_564.91 ATCATTAAATAAATAAG-AAGTAAT--TAGGCTC----GTCCTR---TTACTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTTTGCAGCGTTTGAGGAATGTTCTT--RTGCTATATGGGTAGGTATAA-GAAATGTTAACCGAGCTGTAATCAGGCTTAGGCTTGGTACCC--TGTT-TATATACTTTCA---ATTGATCAGATTTT--AAAATGTAACATAG--AGT---AAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCATTCAAAA----TTTTTTTTGAATGGTCATGAAGGAAGC--------TACTC-GT-TGGCGACCTTTTAAA-TTGAGTAAGGCCT-GAATTTG-TTTATCTAGCCTGAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTGCGACTTGAAC-TTTGTT--GGGGCC Blakeslea_trispora_CBS_130.59 ATCATTAAATAAATAAG-AAGTAAT--TAGGCTC----GTCCTG---TTACTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTTTACAGCGTTTGAGGGATGTTCTT--GTGCTATATGGGTAGGCATAA-GAAATGTTAACCGAGCTGTAATCAGGCTTAGGCTTGGTACCC--TGTT-TATATACTTTCA---ATTGATCAGATTTT--AAAATGTAACATAG--AGT---AAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCATTCAAA---TTTTTTTTTTGAATGGTCATGAAGGAAGC--------TAACTTGT-TGGCGACCTTTTAAA-TTGAGTAAGGCCT-GAATTTG-TTTATCTAGCCTGAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTGCGACTTGAAC-TTTGTT--GGGGCC Blakeslea_trispora_CBS_137.49 ATCATTAAATAAATAAG-AAGTAAT--TAGGCTC----GTCCTG---TTACTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTTTACAGCGTTTGAGGGATGTTCTT--GTGCTATATGGGTAGGCATAA-GAAATGTTAACCGAGCTGTAATCAGGCTTAGGCTTGGTACCC--TGTT-TATATACTTTCA---ATTGATCAGATTTT--AAAATGTAACATAG--AGT---AAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCATTCAAA-----TTTTTTTTGAATGGTCATGAAGGAAGC--------TAACTTGT-TGGCGACCTTTTAAA-TTGAGTAAGGCCT-GAATTTG-TTTATCTAGCCTGAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTGCGACTTGAAC-TTTGTT--GGGGCC Blakeslea_trispora_CBS_198.80 ATCATTAAATAAATAAG-AAGTAAT--TAGGCTC----GTCCTG---TTACTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTTTACAGCGTTTGAGGGATGTTCTT--GTGCTATATGGGTAGGCATAA-GAAATGTTAACCGAGCTGTAATCAGGCTTAGGCTTGGTACCC--TGTT-TATATACTTTCA---ATTGATCAGATTTT--AAAATGTAACATAG--AGT---AAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCATTCAAA---TTTTTTTTTTGAATGGTCATGAAGGAAGC--------TAACTTGT-TGGCGACCTTTTAAA-TTGAGTAAGGCCT-GAATTTG-TTTATCTAGCCTGAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTGCGACTTGAAC-TTTGTT--GGGGCC Choanephora_cucurbitarum_CBS_120.25 ATCATTAAATAAATAAG-AAGTATT-TCGGGCTT----GTCCTGAT-CTACTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTTCATGGCGTTTGAGGGATGTTCTT--GTGCTATATGGGTAGGCATGA-GGAATGTTAACCGAGCTATGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCC--TGTT-TATATACTTTCA---ATTGATCAGATTAT--AAAATGTAACATAGGTAGT---AATATCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCATTCAAAA---TTTTTTTTTGAATGGTCATGAAGGAAGC--------TAGCAA---TGGCGACCTTTTAAA-TTGAGTAAGGCCT-GAATCTG-TTCATCTAGCCTGAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTGCGACTTGGAC-TTTGTT--GGGGCC Choanephora_cucurbitarum_CBS_150.51 ATCATTAAATAAATAAG-AAGTATT-TCGGGCTT----GTCCTGAT-CTACTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTTCATGGCGTTTGAGGGATGTTCTT--GTGCTATATGGGTAGGCATGA-GGAATGTTAACCGAGCTATGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCC--TGTT-TATATACTTTCA---ATTGATCAGATTAT--AAAATGTAACATAGGTAGT---AATATCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCATTCAAAA---TTTTTTTTTGAATGGTCATGAAGGAAGC--------TAGCAA---TGGCGACCTTTTAAA-TTGAGTAAGGCCT-GAATCTG-TTCATCTAGCCTGAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTGCGACTTGGAC-TTTGTT--GGGGCC Choanephora_cucurbitarum_CBS_178.76 ATCATTAAATAAATAAG-AAGTATT-TCGGGCTT----GTCCTGAT-CTACTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTTCATGGCGTTTGAGGGATGTTCTT--GTGCTATATGGGTAGGCATGA-GAAATGTTAACCGAGCTATGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCC--TGTT-TATATACTTTCA---ATTGATCAGATTAT--AAAATGTAACATAGGTAGT---AATATCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCATTCAAAT---TTTTTTTTTGAATGGTCATGAAGGAAGC--------TAGTAA---TGGCGACCTTTTAAA-TTGAGTAAGGCCT-GAATCTG-TTCATCTAGCCTGAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTGCGACTTGGAC-TTTGTT--GGGGCC Choanephora_cucurbitarum_CBS_445.72 ATCATTAAATAAATAAG-AAGTATT-TCGGGCTT----GTCCTGAT-CTACTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTTCATGGCGTTTGAGGGATGTTCTT--GTGCTATATGGGTAGGCATGA-GAAATGTTAACCGAGCTATGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCC--TGTT-TATATACTTTCA---ATTGATCAGATTAT--AAAATGTAACATAGGTAGT---AATATCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCATTCAAAA---TTTTTTTTTGAATGGTCATGAAGGAAGC--------TAGTAA---TGGCGACCTTTTAAA-TTGAGTAAGGCCT-GAATCTG-TTCATCTAGCCTGAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTGCGACTTGGAC-TTTGTT--GGGGCC Choanephora_cucurbitarum_CBS_674.93 ATCATTAAATAAATAAG-AAGTATT-TCGGGCTT----GTCCTGAT-CTACTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTTCATGGCGTTTGAGGGATGTTCTT--GTGCTATATGGGTAGGCATGA-GGAATGTTAACCGAGCTATGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCC--TGTT-TATATACTTTCA---ATTGATCAGATTAT--AAAATGTAACATAGGTAGT---AATATCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCATTCAAAA---TTTTTTTTTGAATGGTCATGAAGGAAGC--------TAGCAA---TGGCGACCTTTTAAA-TTGAGTAAGGCCT-GAATCTG-TTCATCTAGCCTGAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTGCGACTTGGAC-TTTGTT--GGGGCC Choanephora_infundibulifera_CBS_153.51 ATCATTAAATAAATAAG-AAGTATT-TCGGGCTT----GTCCTGAT-TTACTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTTCATAGTGTTTGAGGGATGTTCTT--ATGCTATATGGGTAGGCATAG-GAAATGTTAACCGAGCTATGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCC--TGTT-TATATACTTTCA---ATTGATCAGATTAT--AAAATGTAACATAGGTAGT---AATATCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCATTCAAAA-TCTTTTTTTTTGAATGGTCATGAAGGAAGC--------TAGTTAAA-TGGCAACCTTTTAAA-TTGAGTAAGGCCT-GAATCTG-TTCATCTAGCCTGAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTGCGACTTGGAC-TTTGTT--GGGGCC Choanephora_infundibulifera_CBS_155.51 ATCATTAAATAAATAAG-AAGTATT-TCGGGCTT----GTCCTGAT-TTACTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTTCATAGTGTTTGAGGGATGTTCTT--ATGCTATATGGGTAGGCATAG-GAAATGTTAACCGAGCTATGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCC--TGTT-TATATACTTTCA---ATTGATCAGATTAT--AAAATGTAACATAGGTAGT---AATATCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCATTCAAAA-TCTTTTTTTTTGAATGGTCATGAAGGAAGC--------TAGTTAAA-TGGCAACCTTTTAAA-TTGAGTAAGGCCT-GAATCTG-TTCATCTAGCCTGAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTGCGACTTGGAC-TTTGTT--GGGGCC Choanephora_infundibulifera_CBS_155.58 ATCATTAAATAAATAAG-AAGTATT-TCGGGCTT----GTCCTGAT-TTACTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTTCATAGTGTTTGAGGGATGTTCTT--ATGCTATATGGGTAGGCATAG-GAAATGTTAACCGAGCTATGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCC--TGTT-TATATACTTTCA---ATTGATCAGATTAT--AAAATGTAACATAGGTAGT---AATATCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCATTCAAAA-TCTTTTTTTTTGAATGGTCATGAAGGAAGC--------TAGTTAAA-TGGCAACCTTTTAAA-TTGAGTAAGGCCT-GAATCTG-TTCATCTAGCCTGAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTGCGACTTGGAC-TTTGTT--GGGGCC Gilbertella_hainanensis_CBS_565.91 ATCATTAAATAAATATG------AT-ATAGTCAT----CTTCTGG--CTATTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTACACAGCGCTTGAGGAATGTCTGTT-CTACTATATGGGTAGGTAGGATAGAATGTTAACCGAGCTGTGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCCAATATTATACAAATTTTCA---ATTGATCAG--TATAAATATTGTAACATAGATGGT-AAAACGTCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCACATTCATAA---TTTTGTTGTGAATGGTCATGAAAGAAGCTAGTCTAGTATTAGGT-TGGCGAC-TTTTAAAATATAATAAGGCCT-GAACTTG-TTCATCAAG-CTGAACTTTTTTTTAATATAAACCAAAGTTTTAGCGACTTGAAC-TTTAAT--GGGGCC Gilbertella_persicaria_CBS_190.32 ATCATTAAATAAATATG------AT-ATAGTCAT----CTTCTGG--CTATTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTACACAGCGCTTGAGGAATGTCTGTT-CTACTATATGGGTAGGTAGGATAGAATGTTAACCGAGCTGTGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCCAATATTATACAAATTTTCA---ATTGATCAGA-TATAAATATTGTAACATAGATGGT-AAAACGTCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCACATTCATAA---TTTTGTTGTGAATGGTCATGAAAGAAGCTAAGCTAGTATTAGGT-TGGCGAC-TTTTAAAATATAATAAGGCCT-GAACTTG-TTCATCAAG-CTGAACTTTTTTTTAATATAAACCAAAGTTTTAGTGACTTGAAC-TTTAAT--GGGGCC Gilbertella_persicaria_CBS_246.59 ATCATTAAATAAATATG------AT-ATAGTCAT----CTTCTGG--CTATTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTACACAGCGCTTGAGGAATGTCTGTT-CTACTATATGGGTAGGTAGGATAGAATGTTAACCGAGCTGTGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCCAATATTATACAAATTTTCA---ATTGATCAGA-TATAAATATTGTAACATAGATGGT-AAAACGTCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCACATTCATAA---TTTTGTTGTGAATGGTCATGAAAGAAGCTAAGCTAGTATTAGGT-TGGCGAC-TTTTAAAATATAATAAGGCCT-GAACTTG-TTCATCAAG-CTGAACTTTTTTTTAATATAAACCAAAGTTTTAGCGACTTGAAC-TTTAAT--GGGGCC Gilbertella_persicaria_CBS_325.71D ATCATTAAATAAATATG------AT-ATAGTCAT----CTTCTGA--CTATTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTACACAGCGCTTGAGGAATGTCTGTT-CTACTATATGGGTAGGTAGGATGGAATGTTAACCGAGCTGTGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCCAATATTATACAAATTTTCA---ACTGATCAGA-TATAAATATTGTAACATAGATGGT-AAAACGTCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCACATTCATAA---TTTTGTTGTGAATGGTTATGAAAGAAGCTAAGCTAGTATTAGGT-TGGCGAC-TTTTAAAATATAATAAGGCCT-GAACTTG-TTCATCAAG-CTGAACTTTTTTTTAATATAAACCAAAGTTTTAGCGACTTGAAC-TTTAAT--GGGGCC Gilbertella_persicaria_CBS_325.71a ATCATTAAATAAATATG------AT-ATAGTCAT----CTTCTGG--CTATTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTACACAGCGCTTGAGGAATGTCTGTT-CTACTATATGGGTAGGTAGGATAGAATGTTAACCGAGCTGTGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCCAATATTATACAAATTTTCA---ATTGATCAG--TATAAATATTGTAACATAGATGGTAAAAACGTCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCACATTCATAA---TTTTGTTGTGAATGGTCATGAAAGAAGCTAGTCTAGTATTAGGT-TGGCGAC-TTTTAAAATATAATAAGGCCT-GAACTTG-TTCATCAAG-CTGAACTTTTTTTTAATATAAACCAAAGTTTTAGCGACTTGAAC-TTTAATGGGGGGCC Gilbertella_persicaria_CBS_403.51 ATCATTAAATAAATATG------AT-ATAGTCAT----CTTCTGG--CTATTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTACACAGCGCTTGAGGAATGTCTGTT-CTACTATATGGGTAGGTAGGATAGAATGTTAACCGAGCTGTGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCCAATATTATACAAATTTTCA---ATTGATCAG--TATAAATATTGTAACATAGATGGTAAAAACGTCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCACATTCATAA---TTTTGTTGTGAATGGTCATGAAAGAAGCTAGTCTAGTATTAGGT-TGGCGAC-TTTTAAAATATAATAAGGCCT-GAACTTG-TTCATCAAG-CTGAACTTTTTTTTAATATAAACCAAAGTTTTAGCGACTTGAAC-TTTAATGGGGGGCC Gilbertella_persicaria_CBS_421.77 ATCATTAAATAAATATG------AT-ATAGTCAT----CTTCTGG--CTATTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTACACAGCGCTTGAGGAATGTCTGTT-CTACTATATGGGTAGGTAGGATAGAATGTTAACCGAGCTGTGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCCAATATTATACAAATTTTCA---ATTGATCAGA-TATAAATATTGTAACATAGATGGT-AAAACGTCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCACATTCATAA---TTTTGTTGTGAATGGTCATGAAAGAAGCTAAGCTAGTATTAGGT-TGGCGAC-TTTTAAAATATAATAAGGCCT-GAACTTG-TTCATCAAG-CTGAACTTTTTTTTAATATAAACCAAAGTTTTAGCGACTTGAAC-TTTAAT--GGGGCC Gilbertella_persicaria_CBS_442.64 ATCATTAAATAAATATG------AT-ATAGTCAT----CTTCTGG--CTATTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTACACAGCGCTTGAGGAATGTCTGTT-CTACTATATGGGTAGGTAGGATAGAATGTTAACCGAGCTGTGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCCAATATTATACAAATTTTCA---ATTGATCAG--TATAAATATTGTAACATAGATGGTAAAAACGTCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCACATTCATAA---TTTTGTTGTGAATGGTCATGAAAGAAGCTAGTCTAGTATTAGGT-TGGCGAC-TTTTAAAATATAATAAGGCCT-GAACTTG-TTCATCAAG-CTGAACTTTTTTTTAATATAAACCAAAGTTTTAGCGACTTGAAC-TTTAATGGGGGGCC Gilbertella_persicaria_CBS_532.77 ATCATTAAATAAATATG------AT-ATAGTCAT----CTTCTGA--CTATTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTACACAGCGCTTGAGGAATGTCTGTT-CTACTATATGGGTAGGTAGGATGGAATGTTAACCGAGCTGTGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCCAATATTATACAAATTTTCA---ACTGATCAGA-TATAAATATTGTAACATAGATGGT-AAAACGTCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCACATTCATAA---TTTTGTTGTGAATGGTTATGAAAGAAGCTAAGCTAGTATTAGGT-TGGCGAC-TTTTAAAATATAATAAGGCCT-GAACTTG-TTCATCAAG-CTGAACTTTTTTTTAATATAAACCAAAGTTTTAGCGACTTGAAC-TTTAAT--GGGGCC Gilbertella_persicaria_CBS_785.97 ATCATTAAATAAATATG------AT-ATAGTCAT----CTTCTGG--CTATTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTACACAGCGCTTGAGGAATGTCTGTTCCTACTATATGGGTAGGTAGGATAGAATGTTAACCGAGCTGTGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCCAATATTATACAAATTTTCA---ATTGATCAG--TATAAATATTGTAACATAGATGGTAAAAACGTCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCACATTCATAA---TTTTGTTGTGAATGGTCATGAAAGAAGCTAGTCTAGTATTAGGT-TGGCGAC-TTTTAAAATATAATAAGGCCT-GAACTTG-TTCATCAAG-CTGAACTTTTTTTTAATATAAACCAAAGTTTTAGCGACTTGAAC-TTTAATGGGGGGCC Gilbertella_persicaria_COAD1728 ATCATTAAATAAATATG------AT-ATAGTCAT----CTTCTGG--CTATTA----TCTAT---TTTACTGTGAACTGTTTTA-TTACACAGCGCTTGAGGAATGTCTGTT-CTACTATATGGGTAGGTAGGATAGAATGTTAACCGAGCTGTGGTCAAGCTTAGGCTTGGTACCCAATATTATACAAATTTTCA---ATTGATCAG--TATAAATATTGTAACATAGATGGTAAAAACGTCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCACATTCATAA---TTTTGTTGTGAATGGTCATGAAAGAAGCTAGTCTAGTATTAGGT-TGGCGAC-TTTTAAAATATAATAAGGCCT-GAACTTG-TTCATCAAG-CTGAACTTTTTTTTAATATAAACCAAAGTTTTAGCGACTTGAAC-TTTAATGGGGGGCC Hyphomucor_assamensis_CBS_415.77 ATCATTAAATAATGAAAAAAATAATAGTGGGCTCTCGGGTTCA----TTATTATTTTTTAATCTATTTACTGTGAACTGTATTATTTGCATGGCGCTTGAGAGATGTCTAA--GCATTATATGGATAGATGCTT-GGAATGTTAATCGAGTCATGGTCAAGCTTAGGCTTGGTATCC--TATTAT---TATTTACCAAAAGAATTCAGATTAAAAATATTGTAACATAG--ACCTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCACCTGTTGGTATTCCAACAGGTACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCTTTTAAACATGTTTGTGTTTGAAAGGATTTGAAAGTATC--------TCTTTCGG-GAGAGGCTTTTTAAACTA--CTAAGGCCTGGAATTTGTTCTACCT-GCCTGAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTGCAATTTGAACTTTTATT--GGGGCC Mucor_fuscus_CBS_230.29 ATCATTAAATAATTAAT-----AAT-TTTGGCTC----GTCCA----TCATTA----TCTA----TTTACTGTGAACTGTATTA-TTGTATGGCGCTTGAGAGATGTCTGG--ACATTATATAGGTAGATGTTC-AGAATGCTAATCGAGCCATAATCAAGCTTAGGCTTGGTACCT--TATTAT---TATTTACCAAAAGAATTCAG--TATTAATATTGTAACATAG--ACCTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCCTTTTGGTATTCCAAAAGGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCTTTCAAAC-ATTTTTGTTTAAAAGGATTATGAGAG------------TATTTCATGTAAAGACTCTTTAAA-TAT-CTAAGGCCT-GAGTTTG-TTTATCT-GCCTAAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTTTTGTAA-TTGAACTTTTATT--GGGGCC Mucor_fuscus_CBS_254.48 ATCATTAAATAATTAAT-----AAT-TTTGGCTC----GTCCA----TCATTA----TCTA----TTTACTGTGAACTGTATTA-TTGTATGGCGCTTGAGAGATGTCTGG--ACATTATATAGGTAGATGTTC-AGAATGCTAATCGAGCCATAATCAAGCTTAGGCTTGGTACCT--TATTAT---TATTTACCAAAAGAATTCAG--TATTAATATTGTAACATAG--ACCTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCCTTTTGGTATTCCAAAAGGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCTTTCAAAC-ATTTTTGTTTAAAAGGATTATGAGAG------------TATTTCATGTAAAGACTCTTTAAA-TAT-CTAAGGCCT-GAGTTTG-TTTATCT-GCCTAAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTTTTGTAA-TTGAACTTTTATT--GGGGCC Mucor_fuscus_CBS_282.78 ATCATTAAATAATTAAT-----AAT-TTTGGCTC----GTCCA----TCATTA----TCTA----TTTACTGTGAACTGTATTA-TTGTATGGCGCTTGAGAGATGTCTGG--ACATTATATAGGTAGATGTTC-AGAATGCTAATCGAGCCATAATCAAGCTTAGGCTTGGTACCT--TATTAT---TATTTACCAAAAGAATTCAG--TATTAATATTGTAACATAG--ACCTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCCTTTTGGTATTCCAAAAGGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCTTTCAAAC-ATTTTTGTTTAAAAGGATTATGAGAG------------TATTTCATGTAAAGATTCTTTAAA-TAT-CTAAGGCCT-GAGTTTG-TTTATCT-GCCTAAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTTTTGTAA-TTGAACTTTTATT--GGGGCC Mucor_fuscus_CBS_313.78 ATCATTAAATAATTAAT-----AAT-TTTGGCTC----GTCCA----TCATTA----TCTA----TTTACTGTGAACTGTATTA-TTGTATGGCGCTTGAGAGATGTCTGG--ACATTATATAGGTAGATGTTC-AGAATGCTAATCGAGCCATAATCAAGCTTAGGCTTGGTACCT--TATTAT---TATTTACCAAAAGAATTCAG--TATTAATATTGTAACATAG--ACCTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCCTTTTGGTATTCCAAAAGGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCTTTCAAAC-ATTTTTGTTTAAAAGGATTATGAGAG------------TATTTCATGTAAAGATTCTTTAAA-TAT-CTAAGGCCT-GAGTTTG-TTTATCT-GCCTAAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTTTTGTAA-TTGAACTTTTATT--GGGGCC Mucor_fuscus_CBS_530.77 ATCATTAAATAATTAAT-----AAT-TTTGGCTC----GTCCA----TCATTA----TCTA----TTTACTGTGAACTGTATTA-TTGTATGGCGCTTGAGAGATGTCTGG--ACATTATATAGGTAGATGTTC-AGAATGYTAATCGAGYCATAATCAAGCTTAGGCTTGGTACCT--TATTAT---TATTTACCAAAAGAATTCAG--TAYTAATATTGTAACATAG--ACYTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCCTTTTGGTATTCCAAAAGGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCTTTCAAAC-ATTTTTGTTTAAAAGGATTATGAGAG------------TATTTCATGTAAAGATTCTTTAAA-TAT-CTAAGGCCT-GAGTTTG-TTTATCT-GCCTAAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTTTTGTAA-TTGAACTTTTATT--GGGGCC Poitrasia_circinans_CBS_153.58 ATCATTAAATAAATGAGAAAGTAACTGGGAGCTC-----TTCTGCTCTCATTACTCTTCTAT---TTTACTGTGAACCGTTTTA-TTCCACAACGTTTGAGGAATGTTCTT--ATGCCATAGGGGTAGGCATAT-GAAATGTTAACCGAGTTGTGATCAAGCTTAGGCTTGGTACCC--TGTT-TATATACTTTTATCCATTGATCAGATTAT-AAAAATGTAACATAGGTAGT---AATATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCATTCAAAAGTTTTTTCTTATGAATGGTTATGAAGGAAGCTTTAGC--CCTTGGGCTTGGCAACCTTTTAAA-TTGAGTAAGGCCT-GAATCTGTTTCATCTAGCCTGAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTGCGACTTGAAC-TTTGTT--GGGGCC Poitrasia_circinans_CBS_647.70 ATCATTAAATAAATGAGAAAGTAACTGGGAGCTC-----TTCTGCTCTCATTACTCTTCTAT---TTTACTGTGAACCGTTTTA-TTCCACAACGTTTGAGGAATGTTCTT--ATGCCATAGGGGTAGGCATAT-GAAATGTTAACCGAGTTGTGATCAAGCTTAGGCTTGGTACCC--TGTT-TATATACTTTTATCCATTGATCAGATTAT-AAAAATGTAACATAGGTAGT---AATATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGCTTTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAATTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAAATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGCTCATTGGTATTCCAGTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCATTCAAAAGTTTTTTCTTATGAATGGTTATGAAGGAAGCTTTAGC--CCTTGGGCTTGGCAACCTTTTAAA-TTGAGTAAGGCCT-GAATCTGTTTCATCTAGCCTGAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTGCGACTTGAAC-TTTGTT--GGGGCC ; END; BEGIN TREES; Title Gilbertella_persicaria_and_related_taxa_ITS; LINK Taxa = TaxaForAnalysisStep13816; TRANSLATE 1 Blakeslea_sinensis_CBS_564.91, 2 Blakeslea_trispora_CBS_130.59, 3 Blakeslea_trispora_CBS_137.49, 4 Blakeslea_trispora_CBS_198.80, 5 Choanephora_cucurbitarum_CBS_120.25, 6 Choanephora_cucurbitarum_CBS_150.51, 7 Choanephora_cucurbitarum_CBS_178.76, 8 Choanephora_cucurbitarum_CBS_445.72, 9 Choanephora_cucurbitarum_CBS_674.93, 10 Choanephora_infundibulifera_CBS_153.51, 11 Choanephora_infundibulifera_CBS_155.51, 12 Choanephora_infundibulifera_CBS_155.58, 13 Gilbertella_hainanensis_CBS_565.91, 14 Gilbertella_persicaria_CBS_190.32, 15 Gilbertella_persicaria_CBS_246.59, 16 Gilbertella_persicaria_CBS_325.71D, 17 Gilbertella_persicaria_CBS_325.71a, 18 Gilbertella_persicaria_CBS_403.51, 19 Gilbertella_persicaria_CBS_421.77, 20 Gilbertella_persicaria_CBS_442.64, 21 Gilbertella_persicaria_CBS_532.77, 22 Gilbertella_persicaria_CBS_785.97, 23 Gilbertella_persicaria_COAD1728, 24 Hyphomucor_assamensis_CBS_415.77, 25 Mucor_fuscus_CBS_230.29, 26 Mucor_fuscus_CBS_254.48, 27 Mucor_fuscus_CBS_282.78, 28 Mucor_fuscus_CBS_313.78, 29 Mucor_fuscus_CBS_530.77, 30 Poitrasia_circinans_CBS_153.58, 31 Poitrasia_circinans_CBS_647.70; TREE con_50_majrule = ((24:0.114748,(25:0.002617,26:0.002653,(27:0.002561,28:0.00246,29:0.002588):0.004967):0.09853):0.164404,((14:0.004662,15:0.00242,19:0.002366,(16:0.002399,21:0.002276):0.01007,(13:0.002388,17:0.002307,18:0.002359,20:0.00233,22:0.002238,23:0.002344):0.006859):0.143845,((30:0.00209,31:0.00202):0.086739,(1:0.014605,(2:0.002462,3:0.00244,4:0.00255):0.008709):0.03046,((10:0.002521,11:0.002404,12:0.002445):0.017829,(7:0.004907,8:0.002509,(5:0.002421,6:0.002433,9:0.002372):0.007181):0.011649):0.035266):0.073797):0.164404)[% ] [% ] [% setBetweenBits = selected ]; TREE con_50_majrule = ((24:0.114748,(25:0.002617,26:0.002653,(27:0.002561,28:0.00246,29:0.002588)0.92:0.004967)1.00:0.09853)1.00:0.164404,((14:0.004662,15:0.00242,19:0.002366,(16:0.002399,21:0.002276)0.89:0.01007,(13:0.002388,17:0.002307,18:0.002359,20:0.00233,22:0.002238,23:0.002344)0.82:0.006859)1.00:0.143845,((30:0.00209,31:0.00202)1.00:0.086739,(1:0.014605,(2:0.002462,3:0.00244,4:0.00255)0.74:0.008709)0.96:0.03046,((10:0.002521,11:0.002404,12:0.002445)1.00:0.017829,(7:0.004907,8:0.002509,(5:0.002421,6:0.002433,9:0.002372):0.007181)0.97:0.011649)0.86:0.035266)0.99:0.073797)0.91:0.164404)[% ] [% ] [% setBetweenBits = selected ]; END;