#NEXUS
[written Sat Nov 26 17:44:38 EST 2016 by Mesquite  version 3.03 (build 702) at wl-10-190-115-64.wireless.duke.edu/10.190.115.64]

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	Anzina_carneonivea_X174                       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	Circinaria_hispida_X162                       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	Lambiella_gyrizans_R20                        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	Lambiella_impavida_R10                        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	Lambiella_impavida_R11                        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	Lasallia_pustulata_X151                       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	Loxospora_ochrophaea_X113                     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	Megaspora_verrucosa_X164                      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	Ochrolechia_juvenalis_X111                    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	Orceolina_kerguelensis_X100                   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	Phyllobaeis_erythrella_X134                   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	Placopsis_gelida_P118                         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	Placopsis_perrugosa_X129                      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	Trapelia_coarctata_KS23                       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	Trapelia_glebulosa_KS83                       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	Trapeliopsis_flexuosa_P218                    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	Trapeliopsis_gelatinosa_CP945                 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	Trapeliopsis_gelatinosa_KS70                  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	Trapeliopsis_glaucopholis_CP948               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	Trapeliopsis_granulosa_CP949                  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	Trapeliopsis_granulosa_KS32                   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	Trapeliopsis_granulosa_KS33                   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	Trapeliopsis_granulosa_KS76                   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	Trapeliopsis_haumanii_CP950                   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	Trapeliopsis_percrenata_CP951                 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	Trapeliopsis_percrenata_CP952                 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	Trapeliopsis_percrenata_X145                  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	Trapeliopsis_pseudogranulosa_KS38             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	Trapeliopsis_sp_KS34                          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	Trapeliopsis_steppica_T1323                   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	Trapeliopsis_subconcolor_CP960                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	Trapeliopsis_viridescens_CP959                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AAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAAAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTCTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTACACCTCTCAAGCTCAGCTTGGTATTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCTCGACTTCGGAAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCCTTGGTGATTCATAATAACTTAACGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCTATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACTCAATCCCGATACGGGGAAGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCTTGGCTGTCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGGTTCGGCCGAGCCTTTCCTTCTGGGGAGCCGCATGCCCTTCACTGGGTGTGTCGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAGATAGGACGTTGTGTCTCTATTTTGTTGGTTTCTAGG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CAGGACGTCACAGAGGGTGAGAATCCCGTACGTGACCGGTGGTCAACCCCATGTGAGGCTCCTTC?AC?AGTC?AGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACTGGCC?GAGACCGATAGCGCACAAGTA?AGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTG?AAAGAGAGTTAAAAAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAACCAGACTTGCCCGCGGGTGATCAACCGTCCTTCGGGGCGGTGCACTCGCCCGCGATCAGGCCAGTATCGGTTTCGGCGGCCGGACAAAGACTTCGGGAACGTAGCTCCCCCCGGGGAGTGTTATAGCCCGTCGTGTAATACGGTTAGCTGGGACCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGATACTGGCGTAATGGTTGTCAGCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTTAAACCCATGCGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAGCACCATCGACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTACGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCGTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGA???TCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGCGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AATAAAATTCTAGATAGAGTTATGATAATGACATTTTCTATCTATGTGTCTTGACCAAATCACGTGCCAGCCGTCGCGGTAATACGTGGGAGACTAGTGTTATTCATCTTTAATAGGTTTAAAGGGTACTTAGACGGTCCATTAAACTAAGAGACTAGAGTTTGATGAGATGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTTACTTGGAACAGGCAACGGCGAAAGCAACCCCTTATGTAAAAACTGACGTTGAAGGACGAAGGCTTGGGAC-ACCA?CAGGATTAAATACCCCAGCAGTCCTTGCAGACAATGATGAATGTCATA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CCTTCTGACGATTGCAAAAACAACAACTCCAAGGGTCACCTTTTTCTGTCAACTAGAGCTTCCAAATTTCTGCCATTTCAAGAAGTTAAAATACAAGAAATGGCTGACCAAGTACCTGTTGGCCACATACCTCGGATGCTGACAGTCCATTGCTATGGGACATTGAC?AGGCAAGTCAATCCAGGAGATGTCGTTGACATTGCGGGTATCTTCCTCCCTACGCCATATACCGGCTTCAAAGCTATACGCGCTGGACTACTCACTGATACATATTTGGAGGCTCAACATGTAAATCAGCACAAAAAAGCGTATGATGATCTGGTAGTAGATGCTAAAACATTCCGACGGATAGAGCAATACAAGAACTCCGGACACATGTACGAGTATCTCTCTCGGTCCATCGCACCGGAGATCTACGGACACCTCGACGTGAAAAAGGCTCTTCTGTTACTCCTTATTGGTGGTGTGACCAAAGAAATGGGCGACGGCATGCGGATTCGTGGAGATATCAATATATGCCTCATGGGAGAATGTCGAAAACTAAGAAACTACTGGAGACCGTCTGTCACAACTGTGGCAAGATCTTGGTAGACGAAAGTAATCCCGAATTTGCGGACGCTCTCCGATATCGAGATGCCAAGAGACGCTTTGAGGCAATCTGGCGACTATGCAAGCCMAAATTAGTGTGTGAAAGCATGCAAGTTGGCGATGATAGTGGGAACGAAAAGTCGAAAGAACCGAAGCACGATCACGGTGGTTGTGGCAATCTTCAACCGGAAGTTCGACGGGATGGACTTAGTCTCACGGGCACATGGAAGCCGCAGAAAGGCGACGACGACAACGAAGGCCAGCAACCAGAGAAGAAGAAGATCACTCCAGCAATGGCGCTTAATATATTTCGACACATCTCAGCCCAAGATATCAAGAAGATGGGGTTGAGYAATGACTATGCACGTCCAGAATGGTTGATCATMACGGTTCTACCAGTGCCGCCTCCACCAGTACGGCCCAGTATATCTGTTGATGGCACTGGTCAAGGCATGCGAGGTGAGGATGATTTGACTTACAAACTTGCAGAAATCATCCGGGCCAATCAAAGTGTTCGGCGATGTGAAGCCGAAGGAGCCCCCGCTCATCTTCGACGTACCAATACTCCCATCGGTCGGGATGGTAAGATTGCTAAACCACGACAGCTACATAATACGCATTGGGGCCTTGTCTGTCCGGCTGAGACGCCAGAGGGCCAGGCTTGTGGACTGGTGAAAAATCTTGCGTTGATGTGTTATATCACGGTTGGTACACCCAGTGAGCCGATCATCGACTTCATGATCCAGCGCAATATGGAGGTACTCGAAGAGTATGAGCCTACAAGGTCACCTAACGCAACGAAGATATTTGTCAATGGCGTATGGGTCGGTGTACACAGAAATCCTGCTCACCTAGTGAGCACTGTGCAATCTTTGAGAAGAAGGGGCTTGATTTCCCACGAAGTCAGTCTTGTTCGAGACATCAGAGACCGAGAATTCAAAATATTTACAGATGCTGGGCGTGTCTGTCGGCCATTATTCGTCATCGAAAATGATTCCAAAAGCGCGAATAAGGGAAGCTTGGTTCTAACCAAGGAATTGGTTAATAAGCTGGAAGACGATAAAGACCTACCTGCTGACATGGATCCGGATGAAAGGGCCCAGAAAGTGTTTGGCTGGAATGGATTACTCAGTGCTGGAGCTGTTGAGTTTCTCGACGCTGAGGAAGAGGAAACAGTAATGATATGTATGACCCCAGAAGATCTTGAGACATCTCGGCAGGTGC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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	Xylographa_vitiligo_T1152                     AAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTCTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTACACCTCTCAAGCCCAGCTTGGTATTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCGACTTCGGAAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTCCGGGGCTCCTTGGTGATTCATAATAACTTAACGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCRATGGTTCATTCAAWTTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGKGGCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCTATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACTCAWTCCCRACACGGGGAAGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGATGTCTCGGGCGCGATACCGGTCTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCACAGAGGGTGAGAATCCCGTACGTGACCGGTGGTCAACCCCATGTGAGGCTCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAAAAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAACCAGACTTGCCCGCGGGTGATCAACCGTCCTTCGGGGCGGTGCACTCGCCCGCGATCAGGCCAGTATCGGTTTCAGCAGCCGGACAAAGACCCCGGGAACGTGGCTCCTCTCGGGGAGTGTTATAGCCCGGGGTGTAATACGGTTAGCGGGGACCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGATACTGGCGTAATGGTTGTCAGCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTACCATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAACCCATGCGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAGCACCATCGACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTACGAGCATAGCTGGTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCGTGAATAG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGATAATGACATTTTCTATCTATGTGTCTTGACCAAATCACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTGGAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAATTGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTCTATTAAACTTACAGACTA?AGTTTGATGAGATGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTTACTTGGAACAGGCAACGGCGAAAGCAACTCCTTATGTAAAAACTGACGTTGAAGGACGAAGGCTTGGGAC-ACCAACAGGATTAGATACCCCAGCAGTCCTTGCA?ACAATGATGAATGTCATACTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATGTGGCAACGCA?AAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGGTGGTCCGCAAAACACCTTACCACAATTTGAATACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGATTTTGGTTAGTTCCATAAAATTAACGTAAACCCTTACTTTATAGAGTAGTTCACCGCTATATTGGATACGATAAAAGGGATCAAGACAAGTCAATAT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATCTTCCTCCCTACGCCATACACCGGCTTCAAAGCAATACGCGCTGGACTTCTGACAGATACWTATCTTGAGGCTCARCATGTAAATCAGCMCAAAAAGGCATATGACRATCTTGTTGTAGATGCAAAAACTTTCCGGCGGATAGAGCAATACAAGAACTCCGGACATATGTACGAGTATCTCTCTCGATCGATCGCACCTGAGATCTATGGACACTTGGACGTAAAGAAGGCTCTTCTATTGCTCCTCATTGGTGGTGTGACCAAGGAGATGGGTGACGGGATGCGAATACGTGGGGACATCAATATATGCCTTATGGGWGAATGTSGAAAACCAABAAACTACTGGRGATGGTCTGTCACAATTGTGGCHAGATCTTGGTRGACGAAAGCAMTCCCGARTTTGCGGACGCTCTACGCTATCGA?ATGCTAAGAGACGCTTTGAGGCGATCTGGAGACTCTGCAAGTCGAAATTGGTGWGTGAAAGCATGCCGATTGGCGATGACAACDAGATGGAAAAGTCGAAAGAACCAAGGCATGACCACGGCGGTTGTGGCAACCTTCAACCGGAAGTTCGAAGGGACGGCCTCAGTCTCATGGGCACGTGGAAGCCGCAGAAAGGCGATGATGACAACGAGGGCCCACAGCCAGAGAAGAAAAAGATCACTCCAGCAATGGCTCTTAACATATTTCGACACATCTCAGCCCAAGATGTTAAGAAGATGGGCTTAAGCAACGATTATGCACGTCCCGAATGGTTGATAATTACGGTTCTGCCAGTGCCTCCTCCACCAGTACGGCCTAGCATATCTGTTGATGGCACCGGCCAAGGTATGCGAGGTGAAGATGATTTGACCTATAAACTGGCAGAAATCATCCGGGCCAATCAAAGCGTTCGGCGGTGCGAGGCGGAAGGGGCTCCTGCCCAT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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;



END;

BEGIN CODONS;
	CODONPOSSET * UNTITLED  =  N:  1- 3012, 1: 3013 - 3541\3 3543 - 6663\3, 2: 3014 - 3542\3 3544 - 6664\3, 3: 3015 - 3540\3 3545 - 6665\3;
	CODONPOSSET CodonPositions  =  N:  1- 3012, 1: 3013 - 3541\3 3543 - 6663\3, 2: 3014 - 3542\3 3544 - 6664\3, 3: 3015 - 3540\3 3545 - 6665\3;

	CODESET * UNTITLED   =  universal:  1 -  6665;


END;

BEGIN SETS;
	CHARSET ITS   =   1 -  184;
	CHARSET SSU   =   185 -  1291;
	CHARSET LSU   =   1292 -  2414;
	CHARSET MTSSU   =   2415 -  3012;
	CHARSET MCM7   =   3013 -  3542;
	CHARSET RPB1   =   3543 -  4148;
	CHARSET RPB2   =   4149 -  5726;
	CHARSET EFT   =   5727 -  6665;

END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
	OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS;
	TYPESET * UNTITLED   =  unord:  1 -  6665;

END;

BEGIN MacClade;
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	LastModified -765975075;
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	Editor 00011001110111100100010010 '4' '8' Geneva '9' '256' '1' all;
	EditorPosition '96' '-1' '883' '1863';
	TreeWindowPosition '46' '6' '1027' '1870';
	ListWindow Characters open Geneva '9' '98' '491' '865' '406' 000;
	ListWindow Taxa closed Geneva '9' '50' '10' '129' '490' 100000000;
	ListWindow Trees closed Geneva '9' '50' '10' '276' '490';
	ListWindow TypeSets closed Geneva '9' '50' '10' '276' '490';
	ListWindow WtSets closed Geneva '9' '50' '10' '276' '490';
	ListWindow ExSets closed Geneva '9' '50' '10' '276' '490';
	ListWindow CharSets open Geneva '9' '50' '10' '129' '181';
	ListWindow TaxSets closed Geneva '9' '50' '10' '276' '490';
	ListWindow CharPartitions closed Geneva '9' '50' '10' '276' '490';
	ListWindow CharPartNames closed Geneva '9' '50' '10' '276' '490';
	ListWindow WtSets closed Geneva '9' '50' '10' '276' '490';
	ChartWindowPosition '52' '30' '818' '1380';
	StateNamesSymbols closed Geneva '9' '10' '50' '30' '148' '220';
	WindowOrder Data List Characters List CharSets;
	OtherSymbols & / 00 ? -;
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	Salmo 00000001;
	EditorFile '4';
	ExportHTML _ MOSS '100' 110000;
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	TreeFont Geneva '9' ( normal );
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	MatchChar 00 .;
	EntryInterpretation 01;
	ColorOptions 00;
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	PairAlign '2' '2' '3' '2' '1' '1' '2' '1' '3' 1010;
	BothTools '1';

END;
BEGIN MESQUITECHARMODELS;
	ProbModelSet * UNTITLED   =  'Jukes-Cantor':  1 -  6665;
END;

BEGIN TREES;
	Title 'Trees from "RAxML_207_tree.result"';
	LINK Taxa = Taxa;
	TRANSLATE
[0] 		1 Absconditella_sp_Spribille_39168_P143,
[1] 		2 Acarospora_laqueata_X170,
[2] 		3 Agyrium_rufum_P122,
[3] 		4 Ainoa_geochroa_X125,
[4] 		5 Ainoa_mooreana_T1088,
[5] 		6 Ainoa_mooreana_X124,
[6] 		7 Alectoria_sarmentosa_T638,
[7] 		8 Anamylopsora_pulcherrima_P108,
[8] 		9 Anamylopsora_pulcherrima_X147,
[9] 		10 Anzina_carneonivea_X174,
[10] 		11 Arctomia_delicatula_P166,
[11] 		12 Aspicilia_caesiocinerea_X110,
[12] 		13 Aspicilia_cinerea_X115,
[13] 		14 Baeomyces_heteromorphus_P128,
[14] 		15 Baeomyces_placophyllus_X126,
[15] 		16 Baeomyces_rufus_P78,
[16] 		17 Cetraria_sepincola_T639,
[17] 		18 Circinaria_hispida_X161,
[18] 		19 Circinaria_hispida_X162,
[19] 		20 Circinaria_vagans_T1329,
[20] 		21 Coccotrema_cucurbitula_X118,
[21] 		22 Coccotrema_hahriae_T646,
[22] 		23 Coccotrema_maritimum_X116,
[23] 		24 Coenogonium_leprieurii_X119,
[24] 		25 Coenogonium_luteum_X102,
[25] 		26 Coenogonium_pineti_P167,
[26] 		27 Cyanodermella_viridula,
[27] 		28 Dibaeis_baeomyces_X101,
[28] 		29 Diploschistes_cinereocaesius_X106,
[29] 		30 Diploschistes_ocellatus_X120,
[30] 		31 DTO_301_G1,
[31] 		32 Fissurina_insidiosa_P131,
[32] 		33 Fissurina_insidiosa_X108,
[33] 		34 Geoglossum_nigritum_X168,
[34] 		35 Gyalecta_hypoleuca_X123,
[35] 		36 Gyalecta_jenensis_P142,
[36] 		37 Gyalectaria_diluta_P145,
[37] 		38 Gyalectaria_gyalectoides_X117,
[38] 		39 Heterodermia_speciosa_T636,
[39] 		40 Hymenelia_melanocarpa_T1046,
[40] 		41 Ionaspis_lacustris_X122,
[41] 		42 Ionaspis_ventosa_P126,
[42] 		43 Japewia_subaurifera_T764,
[43] 		44 Lambiella_caeca_P83,
[44] 		45 Lambiella_caeca_P86,
[45] 		46 Lambiella_caeca_P87,
[46] 		47 Lambiella_caeca_T1072,
[47] 		48 Lambiella_caeca_T1073,
[48] 		49 Lambiella_caeca_T586,
[49] 		50 Lambiella_furvella_R06,
[50] 		51 Lambiella_fuscosora_R19,
[51] 		52 Lambiella_globulosa_R05,
[52] 		53 Lambiella_globulosa_R09,
[53] 		54 Lambiella_gyrizans_R20,
[54] 		55 Lambiella_impavida_R04,
[55] 		56 Lambiella_impavida_R10,
[56] 		57 Lambiella_impavida_R11,
[57] 		58 Lambiella_impavida_R12,
[58] 		59 Lambiella_insularis_R17,
[59] 		60 Lambiella_insularis_R18,
[60] 		61 Lambiella_insularis_T1091,
[61] 		62 Lambiella_psephota_X133,
[62] 		63 Lambiella_spacelata_R22,
[63] 		64 Lasallia_pustulata_X151,
[64] 		65 Lithographa_tesserata_P134,
[65] 		66 Lithographa_tesserata_P95,
[66] 		67 Lobothallia_radiosa_X165,
[67] 		68 Loxospora_cismonica_X114,
[68] 		69 Loxospora_elatina_P196,
[69] 		70 Loxospora_ochrophaea_X113,
[70] 		71 Loxosporopsis_corallifera_T1087,
[71] 		72 Megaspora_verrucosa_X163,
[72] 		73 Megaspora_verrucosa_X164,
[73] 		74 Mycoblastus_sanguinarius_T77,
[74] 		75 Ochrolechia_frigida_P168,
[75] 		76 Ochrolechia_juvenalis_X111,
[76] 		77 Ochrolechia_sp_Spribille_38907_P150,
[77] 		78 Ochrolechia_subplicans_subsp_hultenii_P127,
[78] 		79 Ochrolechia_subplicans_subsp._hultenii_T1300,
[79] 		80 Ochrolechia_yasudae_X166,
[80] 		81 Orceolina_antarctica_X128,
[81] 		82 Orceolina_kerguelensis_X100,
[82] 		83 Peltula_auriculata_X169,
[83] 		84 Pertusaria_pertusa_T1298,
[84] 		85 Pertusaria_subvelata_T1331,
[85] 		86 Phlyctis_argena_P188,
[86] 		87 Phyllobaeis_erythrella_X134,
[87] 		88 Phyllobaeis_imbricata_X135,
[88] 		89 Placopsis_bicolor_X130,
[89] 		90 Placopsis_clavifera_P116,
[90] 		91 Placopsis_contortuplicata_X139,
[91] 		92 Placopsis_cribellans_T1074,
[92] 		93 Placopsis_gelida_P118,
[93] 		94 Placopsis_lambii_KS72,
[94] 		95 Placopsis_lambii_X141,
[95] 		96 Placopsis_macrophthalma_X142,
[96] 		97 Placopsis_perrugosa_X129,
[97] 		98 Placopsis_pycnotheca_X138,
[98] 		99 Placopsis_santessonii_X140,
[99] 		100 Placynthiella_icmalea_X136,
[100] 		101 Placynthiella_uliginosa_X137,
[101] 		102 Protothelenella_corrosa_X173,
[102] 		103 Protothelenella_sphinctrinoidella_X172,
[103] 		104 Pseudevernia_cladonia_T611,
[104] 		105 Ptychographa_xylographoides_T1123,
[105] 		106 Ramboldia_cinnabarina_T624,
[106] 		107 Rimularia_badioatra_R07,
[107] 		108 Rimularia_badioatra_T1264,
[108] 		109 Rimularia_gibbosa_T1116,
[109] 		110 Rimularia_gibbosa_T1265,
[110] 		111 Rimularia_gibbosa_T1293,
[111] 		112 Rimularia_intercedens_R16,
[112] 		113 Rimularia_intercedens_R21,
[113] 		114 Rimularia_limborina_R08,
[114] 		115 Rimularia_limborina_T1062,
[115] 		116 Schaereria_cinereorufa_T1292,
[116] 		117 Schaereria_dolodes_T1290,
[117] 		118 Schaereria_fuscocinerea_T1291,
[118] 		119 Schizoxylon_albescens_L547,
[119] 		120 Siphula_ceratites_P110,
[120] 		121 Stictis_radiata_P164,
[121] 		122 Stictis_radiata_X104,
[122] 		123 Thamnolia_vermicularis_P173,
[123] 		124 Thelotrema_lepadinum_P129,
[124] 		125 Thelotrema_lepadinum_X121,
[125] 		126 Thrombium_epigaeum_P171,
[126] 		127 Trapelia_antarctica_P133,
[127] 		128 Trapelia_antarctica_P147,
[128] 		129 Trapelia_chiodectonoides_X131,
[129] 		130 Trapelia_coarctata_KS18,
[130] 		131 Trapelia_coarctata_KS23,
[131] 		132 Trapelia_coarctata_KS24,
[132] 		133 Trapelia_coarctata_KS46,
[133] 		134 Trapelia_coarctata_KS61,
[134] 		135 Trapelia_coarctata_KS62,
[135] 		136 Trapelia_coarctata_KS64,
[136] 		137 Trapelia_coarctata_P141,
[137] 		138 Trapelia_coarctata_P201,
[138] 		139 Trapelia_coarctata_P202,
[139] 		140 Trapelia_coarctata_X143,
[140] 		141 Trapelia_corticola_P92,
[141] 		142 Trapelia_corticola_T1099,
[142] 		143 Trapelia_glebulosa_KS19,
[143] 		144 Trapelia_glebulosa_KS20,
[144] 		145 Trapelia_glebulosa_KS21,
[145] 		146 Trapelia_glebulosa_KS22,
[146] 		147 Trapelia_glebulosa_KS30,
[147] 		148 Trapelia_glebulosa_KS47,
[148] 		149 Trapelia_glebulosa_KS81,
[149] 		150 Trapelia_glebulosa_KS83,
[150] 		151 Trapelia_macrospora_P109,
[151] 		152 Trapelia_obtegens_KS28,
[152] 		153 Trapelia_obtegens_KS57,
[153] 		154 Trapelia_obtegens_T1097,
[154] 		155 Trapeliopsis_aeneofusca_CP1030,
[155] 		156 Trapeliopsis_aeneofusca_CP937,
[156] 		157 Trapeliopsis_colensoi_CP1033,
[157] 		158 Trapeliopsis_colensoi_CP940,
[158] 		159 Trapeliopsis_flexuosa_CP942,
[159] 		160 Trapeliopsis_flexuosa_CP943,
[160] 		161 Trapeliopsis_flexuosa_P218,
[161] 		162 Trapeliopsis_gelatinosa_CP945,
[162] 		163 Trapeliopsis_gelatinosa_KS70,
[163] 		164 Trapeliopsis_glaucolepidea_CP946,
[164] 		165 Trapeliopsis_glaucolepidea_CP947,
[165] 		166 Trapeliopsis_glaucopholis_CP948,
[166] 		167 Trapeliopsis_granulosa_CP949,
[167] 		168 Trapeliopsis_granulosa_KS32,
[168] 		169 Trapeliopsis_granulosa_KS33,
[169] 		170 Trapeliopsis_granulosa_KS36,
[170] 		171 Trapeliopsis_granulosa_KS65,
[171] 		172 Trapeliopsis_granulosa_KS66,
[172] 		173 Trapeliopsis_granulosa_KS76,
[173] 		174 Trapeliopsis_haumanii_CP950,
[174] 		175 Trapeliopsis_percrenata_CP951,
[175] 		176 Trapeliopsis_percrenata_CP952,
[176] 		177 Trapeliopsis_percrenata_X145,
[177] 		178 Trapeliopsis_pseudogranulosa_KS38,
[178] 		179 Trapeliopsis_sp_KS34,
[179] 		180 Trapeliopsis_sp_P104,
[180] 		181 Trapeliopsis_steppica_CP954,
[181] 		182 Trapeliopsis_steppica_T1323,
[182] 		183 Trapeliopsis_subconcolor_CP960,
[183] 		184 Trapeliopsis_viridescens_CP955,
[184] 		185 Trapeliopsis_viridescens_CP959,
[185] 		186 Trapeliopsis_wallrothii_CP956,
[186] 		187 Tremolecia_atrata_X146,
[187] 		188 Umbilicaria_arctica_X149,
[188] 		189 Umbilicaria_mammulata_X150,
[189] 		190 Umbilicaria_muehlenbergii_X148,
[190] 		191 Umbilicaria_polyphylla_T1324,
[191] 		192 Usnea_intermedia_T609,
[192] 		193 Wawea_fruticulosa_X160,
[193] 		194 Xylographa_bjoerkii_T1129,
[194] 		195 Xylographa_carneopallida_T1024,
[195] 		196 Xylographa_constricta_T1147,
[196] 		197 Xylographa_difformis_T2404,
[197] 		198 Xylographa_erratica_T820,
[198] 		199 Xylographa_hians_T1053,
[199] 		200 Xylographa_lagoi_T162,
[200] 		201 Xylographa_opegraphella_T1068,
[201] 		202 Xylographa_pallens_T1133,
[202] 		203 Xylographa_parallela_T1151,
[203] 		204 Xylographa_septentrionalis_T2402,
[204] 		205 Xylographa_soralifera_T1117,
[205] 		206 Xylographa_trunciseda_T1050,
[206] 		207 Xylographa_vitiligo_T1152;
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444007743):0.04454615312440357,(132:0.07372484663165585,((153:0.00000100000050002909,(152:0.02761114378845242,154:0.001936297041407422):0.00000100000050002909):0.08419663210462434,((135:0.00000100000050002909,(((145:0.032856659008938444,149:0.00000100000050002909):0.0063846268486900636,150:0.0025324286989215033):0.003507559745841948,(133:0.003364490612538777,(143:0.01557584308477183,146:0.0003683956199612456):0.006176992087597015):0.0019719100299469346):0.0010584105993943723):0.008342309932754912,(147:0.01299004275632814,(138:0.0025315777804544603,148:0.00000100000050002909):0.003452896951067301):0.010602557970071244):0.06718417808485674):0.0321401650436133):0.19150070347825932):0.07960423481751164,(142:0.029473709115971497,141:0.016245510845861982):0.25999962876498506):0.03902849566326045):0.0450028844933118):0.05401579135281423,((((108:0.06360077450681267,(111:0.009243169287359389,((112:0.0073959115406008104,113:0.015142581847753843):0.0038761336818021156,107:0.024060875392650623):0.004037474117484667):0.03783697341777086):0.026975791929631492,(110:0.00000100000050002909,109:0.00000100000050002909):0.09231481361279002):0.17545110469109432,114:0.2121034694195542):0.036899952065079324,115:0.22113873990193048):0.15137553829154027):0.029576515239219645):0.06935487914275286,(((40:0.22619974356072814,(187:0.20866961316910776,(42:0.27114500168669153,41:0.2985986493559005):0.06622777996619639):0.00000100000050002909):0.14997030809524273,((6:0.005340334379017767,5:0.004402447086248059):0.3154988891058936,((9:0.00000100000050002909,8:0.00000100000050002909):0.27648393459027204,(((16:0.014293292774612693,15:0.08137229105321811):0.10536611293630709,(14:0.05057761532550156,(87:0.05402750560013041,88:0.026456650406901074):0.11564230749508883):0.12012596370780844):0.09212416028448185,(4:0.2366173677323247,183:0.00000100000050002909):0.16127526881225937):0.0990982681333107):0.04680548378786642):0.08336838719692861):0.021131145407444204,((193:0.1348597890724261,11:0.22260303544028548):0.31098123992915616,((((86:0.30012752532443443,(35:0.4343463078875126,36:0.2725122177920589):0.46884313939394234):0.008268819309597752,((32:0.06837602334958123,33:0.12412936754929017):0.46405190485347764,(((124:0.0017181287808609163,125:0.001968657935170621):0.5891003286508797,29:0.4631169274120757):0.05636404558446277,30:0.38015056672784436):0.13968424847580183):0.29777003745539105):0.05944956524556789,(26:0.9221803627214367,(24:0.3463876989778164,25:0.49940120768966656):0.46517324917247815):0.15189162833509776):0.09717097029976408,((27:1.1747824607489379,31:0.48231112630108736):0.49575719178100486,(1:0.5858269827328447,(119:0.4607950181684954,(121:0.23521331524866207,122:0.09867975368413706):0.3026018972603436):0.11997637237962476):0.04156614871896354):0.056335444147841605):0.15779263823760187):0.03645544942790484):0.025276561367696505):0.020840249045992167):0.03848077875258434,((126:0.4159685745951571,(3:0.5191375823885536,(84:0.3174185802569846,71:0.22533651911873098):0.35695858392016555):0.06021337968461956):0.07857419686218854,((85:0.4724602041238455,((75:0.14132360472926755,(((79:0.00000100000050002909,78:0.009706921779255308):0.1259559128855408,(77:0.10906612736942192,80:0.10060185953365784):0.02282527363725808):0.0275462344140016,76:0.10627640385370835):0.0008796553725544172):0.31783830304393007,(67:0.2031350959012684,((12:0.03229985174776029,13:0.028219136242014574):0.1304719210805503,((72:0.04647684014113893,73:0.24433682972667767):0.09670723003187932,((18:0.0021585291371834544,19:0.07678577169255132):0.012730006815394457,20:0.057607403484577005):0.06893785509551308):0.035298853933975624):0.058877774902133334):0.19148919790328767):0.005527775741428251):0.054740627559287144,(((38:0.13333848449286748,37:0.09368978774156113):0.08909737847146135,(21:0.3614271897206978,(22:0.02262715723817208,23:0.030579514204889476):0.05747120443450993):0.1242186215067113):0.2881378456961825,((120:0.17439461657467883,28:0.15587283697452997):0.23603520910270664,123:0.1551948633589856):0.32875416661637463):0.0790056424400442):0.024559068298807954):0.0570181264490311):0.0479443102673809):0.0375647193032102,(68:0.09656286855334618,(70:0.00716671720957775,69:0.00000100000050002909):0.2644362568285637):0.5204483484662261):0.07350332147699352,(189:0.30295519902663554,(64:0.20150382723452132,(190:0.08068432956401679,(191:0.03819367664790828,188:0.014936931765737155):0.1591044591931007):0.012723209608803078):0.06719452453427277):0.20504134817047617):0.071153367532821):0.10524474946889927,2:0.440232753752699):0.25053354767663494):0.21353612709826914,34:0.21353612709826914);

END;


Begin MESQUITE;
		MESQUITESCRIPTVERSION 2;
		TITLE AUTO;
		tell ProjectCoordinator;
		timeSaved 1480200279658;
		getEmployee #mesquite.minimal.ManageTaxa.ManageTaxa;
		tell It;
			setID 0 8451382511388689856;
		endTell;
		getEmployee #mesquite.charMatrices.ManageCharacters.ManageCharacters;
		tell It;
			setID 0 6316513604900629931;
			mqVersion 303;
			checksumv 0 3 4201867651 null  getNumChars 6665 numChars 6665 getNumTaxa 207 numTaxa 207   short true   bits 2305843009213693967   states 15   sumSquaresStatesOnly 1.1973628E7 sumSquares -1.046852726183017E21 longCompressibleToShort false usingShortMatrix true   NumFiles 1 NumMatrices 1;
			mqVersion;
		endTell;
		getWindow;
		tell It;
			suppress;
			setResourcesState false false 100;
			setPopoutState 400;
			setExplanationSize 0;
			setAnnotationSize 0;
			setFontIncAnnot 0;
			setFontIncExp 0;
			setSize 1400 847;
			setLocation 8 23;
			setFont SanSerif;
			setFontSize 10;
			getToolPalette;
			tell It;
			endTell;
			desuppress;
		endTell;
		getEmployee  #mesquite.trees.BasicTreeWindowCoord.BasicTreeWindowCoord;
		tell It;
			makeTreeWindow #8451382511388689856  #mesquite.trees.BasicTreeWindowMaker.BasicTreeWindowMaker;
			tell It;
				suppressEPCResponse;
				setTreeSource  #mesquite.trees.StoredTrees.StoredTrees;
				tell It;
					setTreeBlock 1;
					toggleUseWeights off;
				endTell;
				setAssignedID 1132.1480200259760.6040663954696351325;
				getTreeWindow;
				tell It;
					setExplanationSize 30;
					setAnnotationSize 20;
					setFontIncAnnot 0;
					setFontIncExp 0;
					setSize 1300 775;
					setLocation 8 23;
					setFont SanSerif;
					setFontSize 10;
					getToolPalette;
					tell It;
					endTell;
					setActive;
					getTreeDrawCoordinator #mesquite.trees.BasicTreeDrawCoordinator.BasicTreeDrawCoordinator;
				tell It;
					suppress;
					setTreeDrawer  #mesquite.trees.SquareLineTree.SquareLineTree;
					tell It;
						setNodeLocs #mesquite.trees.NodeLocsStandard.NodeLocsStandard;
						tell It;
							branchLengthsToggle on;
							toggleScale on;
							toggleBroadScale off;
							toggleCenter on;
							toggleEven on;
							setFixedTaxonDistance 0;
						endTell;
						setEdgeWidth 4;
						showEdgeLines on;
						orientUp;
					endTell;
					setBackground White;
					setBranchColor Black;
					showNodeNumbers off;
					showBranchColors on;
					labelBranchLengths off;
					centerBrLenLabels on;
					showBrLensUnspecified on;
					showBrLenLabelsOnTerminals on;
					setBrLenLabelColor 0 0 255;
					setNumBrLenDecimals 6;
					desuppress;
					getEmployee #mesquite.trees.BasicDrawTaxonNames.BasicDrawTaxonNames;
					tell It;
						setColor Black;
						toggleColorPartition off;
						toggleColorAssigned on;
						toggleShadePartition off;
						toggleShowFootnotes on;
						toggleNodeLabels on;
						toggleCenterNodeNames off;
						toggleShowNames on;
						namesAngle ?;
					endTell;
				endTell;
					setTreeNumber 1;
					setDrawingSizeMode 0;
					toggleLegendFloat on;
					scale 0;
					toggleTextOnTree off;
					showWindow;
				endTell;
				desuppressEPCResponse;
				getEmployee #mesquite.trees.ColorBranches.ColorBranches;
				tell It;
					setColor Red;
					removeColor off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.BranchNotes.BranchNotes;
				tell It;
					setAlwaysOn off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.ColorTreeByPartition.ColorTreeByPartition;
				tell It;
					colorByPartition off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.DrawTreeAssocDoubles.DrawTreeAssocDoubles;
				tell It;
					setOn on;
					setDigits 4;
					writeAsPercentage off;
					toggleCentred off;
					toggleHorizontal on;
					toggleWhiteEdges on;
					setFontSize 10;
					setOffset 0  0;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.DrawTreeAssocStrings.DrawTreeAssocStrings;
				tell It;
					setOn on;
					toggleCentred on;
					toggleHorizontal on;
					setFontSize 10;
					setOffset 0  0;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.trees.TreeInfoValues.TreeInfoValues;
				tell It;
					panelOpen false;
				endTell;
			endTell;
		endTell;
		getEmployee  #mesquite.charMatrices.BasicDataWindowCoord.BasicDataWindowCoord;
		tell It;
			showDataWindow #6316513604900629931 #mesquite.charMatrices.BasicDataWindowMaker.BasicDataWindowMaker;
			tell It;
				getWindow;
				tell It;
					setExplanationSize 30;
					setAnnotationSize 20;
					setFontIncAnnot 0;
					setFontIncExp 0;
					setSize 1300 775;
					setLocation 8 23;
					setFont SanSerif;
					setFontSize 10;
					getToolPalette;
					tell It;
					endTell;
					setTool mesquite.charMatrices.BasicDataWindowMaker.BasicDataWindow.arrow;
					colorCells  #mesquite.charMatrices.ColorByState.ColorByState;
				tell It;
					setStateLimit 9;
					toggleUniformMaximum on;
				endTell;
					colorRowNames  #mesquite.charMatrices.TaxonGroupColor.TaxonGroupColor;
					colorColumnNames  #mesquite.charMatrices.CharGroupColor.CharGroupColor;
					colorText  #mesquite.charMatrices.NoColor.NoColor;
					setBackground White;
					toggleShowNames on;
					toggleShowTaxonNames on;
					toggleTight off;
					toggleThinRows off;
					toggleShowChanges off;
					toggleSeparateLines off;
					toggleShowStates on;
					toggleAutoWCharNames off;
					toggleAutoTaxonNames off;
					toggleShowDefaultCharNames off;
					toggleConstrainCW on;
					toggleBirdsEye off;
					toggleShowPaleGrid off;
					toggleShowPaleCellColors off;
					toggleShowPaleExcluded off;
					togglePaleInapplicable on;
					toggleShowBoldCellText off;
					toggleAllowAutosize off;
					toggleColorsPanel off;
					toggleLinkedScrolling on;
					toggleScrollLinkedTables off;
				endTell;
				showWindow;
				getWindow;
				tell It;
					forceAutosize;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.ColorCells.ColorCells;
				tell It;
					setColor Red;
					removeColor off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.categ.StateNamesStrip.StateNamesStrip;
				tell It;
					showStrip off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.AnnotPanel.AnnotPanel;
				tell It;
					togglePanel off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.CharReferenceStrip.CharReferenceStrip;
				tell It;
					showStrip off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.QuickKeySelector.QuickKeySelector;
				tell It;
					autotabOff;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.SelSummaryStrip.SelSummaryStrip;
				tell It;
					showStrip off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.align.AlignToDropped.AlignToDropped;
				tell It;
					gapCosts 8 3 2 2;
					subCosts  10 5 10 10 10 5 5 10 10 10 5 10;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.molec.ColorByAA.ColorByAA;
				tell It;
					emphasizeDegeneracy off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.molec.SequenceInfoEditor.SequenceInfoEditor;
				tell It;
					panelOpen false;
				endTell;
			endTell;
		endTell;
		endTell;
end;