#NEXUS BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=21; TAXLABELS Eulecanium_kunoense_AB440071 Ericerus_pela_JF700162 Drepanococcus_chiton_JX853913 Paralecanium_frenchii_JX853910 Paralecanium_expansum_JX853909 Pulvinaria_psidii_AB440072 Coccus_formicarii_JX853906 'Coccus hesperidum Gi_291GU936950' Milviscutulus_mangiferae_JX845482 Protopulvinaria_pyriformis_JX853912 Ceroplastes_rubens_JQ795722 Ceroplastes_sp._DSP_2010_GU936955 Ceroplastes_ceriferus_JQ795692 Ceroplastes_pseudoceriferus_JQ795694 Ceroplastes_japonicus_JQ795716 Ceroplastes_floridensis_JQ795718 Ceroplastes_kunmingensis_JQ795704 Neosaissetia_tropicalis_JX853911 Ceroplastes_Ex._Parasitaxus_usta_KM102757 Planococcus_citri_GU936938 Phenacoccus_solani_GU936937 ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE Coccidae; DIMENSIONS NCHAR=561; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX Eulecanium_kunoense_AB440071 ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????attagttccattaataataaattcatcagatttaatataccctcgaataaacaatttaagattctgattattatttccatctctaataataataatattaagaatattcgtaaaaaataaaatttatacaggatgaactttatatccaccattatcaattcaaaataacacatcaatcaatataatcattttttctattcacttaaatggaatatcatcaattataagttcaataaactttataatttcaataataaacataaattcaaataaacaaacaataagaaacttatcattatattgctgatcaattataattacatcaatattattaattttatctgtaccagtactagcaagaggtattactataattattatagaccataatataaatacaatattttttaatcctataggaaatggtaat Ericerus_pela_JF700162 cgaattgaactaataaatactaataataattttaataataatataatttactatataataattacaattcatgcatttttaataattttctttataactataccaatcattattggtagatttaggaactgattaattccaataataataaactcatcagatttaatatacccacgaataaataatcttagtttttgaatattatttccatcaataataataataatgataagaatatttatcaacaataaaatctatacaggatgaacaatatatccacctttatctattcaaaacaataattcaattaacataattattttttctattcatttaaacggaatatcatcaattttaagatctataaattttataatttcaataagttatataaactcaaataaacaattaataaggaatataaccttatattgttgatctattataattacatcaatattactaattttatctattccagtattagcaagaggaattacaataattattttagaccataatataaatacaatattttttaacccaataggaaatggtaat Drepanococcus_chiton_JX853913 cgaatcgaactaataaatctaaatcttaacttaaataatacatctacttactatatatttattacaattcacgctttattaataattttttttataactatacctattattatcggaagattcagtaattgattaattcctctattagtctcatcatcagatttaatatttccacgtataaacaatctaagattttggctactttttccgtctctcatactaataacaataagcatatttatgaacaataaaatcttcactggatgaacattatatccacccctatcagttcaaaacactttatcaattaatttaattattttttctattcacttaaacggtatatcatcaattttaagatcaataaatttcattaactcaatattaactataaatataaataaaatatatataaaaaatatatctttatattgttgatctattataatcacatcattcttattaattatttcagtacctgtattagcaagggggatcactataattttactagatcataattttaacacaatattttttaatccgtcaggcaatggaaac Paralecanium_frenchii_JX853910 cgaattgaactaatatcaacaaacaataatataataaataattcaatatactacataactatcactattcatgcatttataataatttttttcataactatacccgtaattattggaagatttagaaattgaataattccactaataattctatctacagatttaatgtttccacgattgaataacttaagattctgacttttatttccttcattaacaactatactatcaagaatatttattaaaaacaaaatctttactggatgaactctttatcctcctttatcaaatcaaaatataaattcaatcaatttaatcatcttttcccttcacataaacggattgtcatcaattttaagatcaataaattttatttcatcaataacgaacataaatacaaataaatttttaataaataacatatctttatattgttgatcaatcttagttacttcaattctattaattatatcaattccagtattagccagaggaattactataattatcatagaccaaaacttcaactcaatattttttaatccattaggaaatggaaat Paralecanium_expansum_JX853909 cgtattgagctaataaaactaaataacagaataaatacagcttctttatactatataatagtaactattcatgcatttttaataattttttttataacaatacccattattattggtagatttagaaactggcttatcccattaataatttcatcatcggatttaatatacccacgattaaataattttagaatatggttattaattccttcaataataataatattaacaagaatatttatcaaaaataaaatttttacaggatgaacaatatatccaccattatcaattcaaaataatacatctattaattttatcgtattatcacttcatataaatggtatatcatctattataagatcaataaattttatagtatcaataataaatataagaccaaacaaatttttaataaataatttatctttatattgctgatcaattataattacatcattattattaatcttatcaattccagtattagccagaggtattaccataattattatggatcataatttcaattctatatttttcaacccaataggaaatggtaat Pulvinaria_psidii_AB440072 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cgaattgaattaataaacaatataaacaattttagattcagattaacttactatataataatcacaattcacgccctattaataatcttctttataacaataccaatcattattggagtatttagaaactgattaatcccattaataatagctactcaagatttaatttacccacgattaaacaatttaagaatatgaattttatttccatccctaatattaataacactgagaatattcataaaaaataaaatctttacaggatgaaccctatatccacctctatcaatccaaaattcaacatcaatcaacctaatcattctatctttacatttaaatggattatcatcaattataagatcaataaactttacaatctcaataataaatataaattcaaataaaatatttatagataatcttaccttatactgctgatcaattatcgtaacatctatattaattattttatcaattccagtactagctagaggaatcacaataatcatcctagaccataattttaattcaatattttttaatccaatcggaaatgggaac 'Coccus hesperidum Gi_291GU936950' 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cgtattgaattaattaatataaataataattttaataataatataatttactatataataattactcttcatgcttttattataattttttttataactatacctattattattggaagatttagaaattgactattacctttaataatctcatcttcagatttaatattccctcgattaaataattttagattctgacttcttttaccttctttaatattaataattttaaatataatattaaataataatattaatacaggttgaactttatatcctcctttaattaatcaaaattttattaccttaaattttattattttttctttacatttaaatggtttatcatcaatttttagatcaattaattttatttcttctattatagtaattaataataataatttttttttaaataatttaactttatatacatgatcaattataattacaacatttttattaattgtttctattccaattctttctagagcaattacaataattattttagataataatttaaatataaatttttttaatcctttaggaaatggaaat ; END; begin mrbayes; log start filename = SCOI.log; unlink statefreq = ( all ) revmat = ( all ) shape = ( all ) pinvar = ( all ); lset nst = 6 rates = invgamma; prset statefreqpr = fixed ( 0.4232 , 0.1207 , 0.0303 , 0.4258 ) revmatpr = fixed ( 1.0000 , 10.3573 , 1.0000 , 1.0000 , 21.3372 , 1.0000 ) pinvarpr = fixed ( 0.3640 ) shapepr = exponential ( 0.7130 ); mcmcp nruns = 2 ngen = 10000000 relburnin = yes burninfrac = 0.25 printfreq = 1000 samplefreq = 1000 nchains = 4 savebrlens = yes; mcmc; sump; sumt; END; BEGIN TREES; Title Coccidae_Bayesian; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE [0] 1 Eulecanium_kunoense_AB440071, [1] 2 Ericerus_pela_JF700162, [2] 3 Drepanococcus_chiton_JX853913, [3] 4 Paralecanium_frenchii_JX853910, [4] 5 Paralecanium_expansum_JX853909, [5] 6 Pulvinaria_psidii_AB440072, [6] 7 Coccus_formicarii_JX853906, [7] 8 'Coccus hesperidum Gi_291GU936950', [8] 9 Milviscutulus_mangiferae_JX845482, [9] 10 Protopulvinaria_pyriformis_JX853912, [10] 11 Ceroplastes_rubens_JQ795722, [11] 12 Ceroplastes_sp._DSP_2010_GU936955, [12] 13 Ceroplastes_ceriferus_JQ795692, [13] 14 Ceroplastes_pseudoceriferus_JQ795694, [14] 15 Ceroplastes_japonicus_JQ795716, [15] 16 Ceroplastes_floridensis_JQ795718, [16] 17 Ceroplastes_kunmingensis_JQ795704, [17] 18 Neosaissetia_tropicalis_JX853911, [18] 19 Ceroplastes_Ex._Parasitaxus_usta_KM102757, [19] 20 Planococcus_citri_GU936938, [20] 21 Phenacoccus_solani_GU936937; TREE Fig._2 = ((21:0.070097,20:0.083388):0.067351,(4:0.137232,(3:0.154971,((1:0.076232,2:0.080809):0.041911,(5:0.138696,(6:0.086684,(18:0.102535,(9:0.049772,10:0.124681):0.036747,((7:0.071425,8:0.075486):0.048552,(11:0.053376,((16:0.040734,(15:0.045788,17:0.059951):0.017811):0.045844,((12:0.008142,13:0.0117):0.020377,(14:0.008401,19:0.01337):0.025009):0.035675):0.015853):0.030877):0.020788):0.012773):0.046229):0.018261):0.026999):0.01022):0.067351); END;