#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 15, 2026; 13:11 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Von mering S., & Kadereit J. 2010. "Systematics, phylogeny, and recircumscription of Juncaginaceae - a cosmopolitan wetland family." In: , eds. Proceedings of the Fourth International Conference on the Comparative Biology of the Monocotyledons and the Fifth International Symposium on Grass Systematics and Evolution. pp. . Aarhus, Aarhus University Press. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10303] [ The following blocks are input data for analysis step 5735 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep5735; DIMENSIONS NTAX=23; TAXLABELS Acorus_calamus Arisaema_triphyllum Butomus_umbellatus Caldesia_oligococca Cymodocea_serrulata Gymnostachys_anceps Lilaea_scilloides Maundia_triglochinoides Orontium_aquaticum Ottelia_acuminata Pleea_tenuifolia Potamogeton_natans Sagittaria_latifolia Scheuchzeria_palustris Tetroncium_magellanicum Tofieldia_calyculata Triglochin_barrelieri Triglochin_elongata Triglochin_laxiflora Triglochin_maritima Triglochin_maritima_AY299852 Triglochin_rheophila Triglochin_striata ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4805] TITLE Alismatales_atpA; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5735; DIMENSIONS NCHAR=903; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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????????TATTAAAGAAGGAGATCTTGTCAAGCCCACTGGGTCTTTTGTGGATGTTCCCGCAGGAAAATCCTTGTTAGGCCGTGTGGTCGATGCTTTGGGAGTACCCATTGATGGCAGAGGTTCTCTAAGCGATCACGAACGAAGACGGGTCGAAGTGAAAGCCCCAGGTATTATTGAGCGTCGATCTGTGCACGAACCCATGCAAACTGGCTTAAAAGCGGTGGATAGCCTGGTTCCTATAGGTCGTGGTCAACGAGAATTGATAATTGGAGACAGGCAAACAGGAAAAACCGCTATAGCAGTAGATACCATATTAAACCAAAAAGAACTGAATGCAACGGCAAAA---GAAAATGAGAAATTGTATTGTGTCTATGTGGCGATTGGGCAGAAACGCTCGACTGTGGCACAATTAGTGCAAATTCTTGAATCAGCAAATGCATTGGAATATTCCATTCTTGTAGCAGCCACCGCTTCGGATCCTGCTCCCCTACAATTTTTGTCCCCATATTCTGGCTGTGCCCTGGGGGAATATTTCCGCGATAATGGAATGCACGCATTAATCATATATGATGATTTGAGTAAACAGGCAGTGGCATATCGCCAAATGTCATTATTGTTACGCCGACCACCAGGCCGAGAGGCTTTCCCCGGGGACGTCTTCTACTTGCATTCCCGTCTCTTAGAAAGAGCGGCTAAACGATCTGAAGAGACAGGAGCAG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Alismatales_atpA) = N: 1-903; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = Alismatales_atpA) = N: 1-903; END; [ The following blocks are output data for analysis step 5735 ] BEGIN TREES; TITLE Tb11394; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5735; TREE Fig._2c = [&R] (Acorus_calamus,(((Arisaema_triphyllum,(Gymnostachys_anceps,Orontium_aquaticum)),(Pleea_tenuifolia,Tofieldia_calyculata)),((Butomus_umbellatus,(((((Lilaea_scilloides,((Triglochin_elongata,Triglochin_laxiflora),Triglochin_barrelieri)),Triglochin_striata),(Triglochin_maritima,Triglochin_maritima_AY299852)),Triglochin_rheophila),Tetroncium_magellanicum),Maundia_triglochinoides,Ottelia_acuminata,Potamogeton_natans,Cymodocea_serrulata,Scheuchzeria_palustris),(Caldesia_oligococca,Sagittaria_latifolia)))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr6842] END;