#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on June 15, 2026; 9:53 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Scanlon J., & Lee M. 2010. "The Major Clades of Living Snakes." In: , eds. Reproductive Biology and Phylogeny of Snakes. pp. . , . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10311] [ The following blocks are input data for analysis step 5752 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep5752; DIMENSIONS NTAX=30; TAXLABELS Acrochordus_sp. Agamidae Anilius_sp. Anomalepididae Anomochilus_sp. Aspidites_clade Boa_sp. Bolyeriinae Calabaria_sp. Candoia_sp. Colubroidea_s.s. Cylindrophis_maculatus Cylindrophis_ruffus Epicrates_clade Eryx_sp. Exiliboa_sp. Leptotyphlopidae Lichanura_clade Loxocemus_sp. Python_clade Trachyboa_sp. Tropidophis_sp. 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TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4812] TITLE 'Major Clades of Snakes, Nucleotides'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5752; DIMENSIONS NCHAR=15174; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Bolyeriinae 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Cylindrophis_ruffus 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Leptotyphlopidae 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Typhlopidae 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Varanidae 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Viperidae 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Xenophidion_sp. 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?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ; END; BEGIN SETS; CHARSET AMBIGUOUS (CHARACTERS = 'Major Clades of Snakes, Nucleotides') = 14453-14457 14463-14466 14528-14532 14572-14574 14596-14607 14625-14636 14689-14693 14888-14910 14962-14992 15005-15014; CHARSET MITO (CHARACTERS = 'Major Clades of Snakes, Nucleotides') = 13231-14452 14458-14462 14467-14527 14533-14571 14575-14595 14608-14624 14637-14688 14694-14887 14911-14961 14993-15004 15015-15174; CHARSET NUCLEAR (CHARACTERS = 'Major Clades of Snakes, Nucleotides') = 1-13230; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = 'Major Clades of Snakes, Nucleotides') = N: 1-15174; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = 'Major Clades of Snakes, Nucleotides') = N: 1-15174; END; [ The following blocks are output data for analysis step 5752 ] BEGIN TREES; TITLE Tb11411; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5752; TREE strict = [&R] (Agamidae,(Varanidae,(((Leptotyphlopidae,Typhlopidae),Anomalepididae),((Anilius_sp.,(Trachyboa_sp.,Tropidophis_sp.)),(((Cylindrophis_ruffus,Cylindrophis_maculatus),(Uropeltinae,Anomochilus_sp.)),((Xenopeltis_sp.,(Loxocemus_sp.,(Aspidites_clade,Python_clade))),((Calabaria_sp.,((Lichanura_clade,(Exiliboa_sp.,Ungaliophis_sp.)),(Eryx_sp.,((Boa_sp.,Epicrates_clade),Candoia_sp.)))),(Bolyeriinae,((Acrochordus_sp.,(Xenoderminae,(Viperidae,Colubroidea_s.s.))),Xenophidion_sp.))))))))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr6790] END;