#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on June 11, 2026; 10:22 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Thines M. 2010. Recent outbreaks of downy mildew on grape ivy (Parthenocissus tricuspidata, Vitaceae) in Germany are caused by a new species of Plasmopara. Mycological Progress, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10692] [ The following blocks are input data for analysis step 6210 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep6210; DIMENSIONS NTAX=25; TAXLABELS Graminivora_graminicola_DQ365702 Peronospora_aparines_DQ365717 Peronospora_arvensis_DQ365719 Peronospora_belbahrii_FJ394342 Peronospora_belbahrii_FJ394343 Peronospora_elsholtziae_FJ527435 Peronospora_perillae_FJ527437 Peronospora_pulveracea_DQ365727 Peronospora_sanguisorbae_DQ365729 Plasmopara_angustiterminalis_EU743812 Plasmopara_angustiterminalis_EU826097 Plasmopara_halstedii_EU743813 Plasmopara_muralis_HO_FJ394346 Plasmopara_obducens_DQ365757 Plasmopara_penniseti_EF426475 Plasmopara_siegesbeckiae_EU743814 Plasmopara_sp_ex_Ambr_EU743818 Plasmopara_sp_ex_Ambr_EU743819 Plasmopara_sp_ex_Ambr_EU743820 Plasmopara_viticola_DQ365760 Plasmopara_viticola_EF426553 Pseudoperonospora_cubensis_EU826099 Pseudoperonospora_humuli_DQ365763 Pseudoperonospora_urticae_DQ365764 Viennotia_oplismeni_DQ365769 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M6128] TITLE COX2; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep6210; DIMENSIONS NCHAR=508; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=- GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Graminivora_graminicola_DQ365702 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(Viennotia_oplismeni_DQ365769:0.05996,Plasmopara_penniseti_EF426475:0.166739,((((((Peronospora_pulveracea_DQ365727:0.111951,((Peronospora_belbahrii_FJ394342:0.003115,Peronospora_belbahrii_FJ394343:0.003235)1.00:0.041692,Peronospora_elsholtziae_FJ527435:0.028462)1.00:0.109896)0.36:0.018777,(Peronospora_aparines_DQ365717:0.194945,(Peronospora_sanguisorbae_DQ365729:0.142711,Peronospora_perillae_FJ527437:0.114843)0.88:0.049186)0.28:0.021827)0.77:0.022678,Peronospora_arvensis_DQ365719:0.187641)0.93:0.040106,((Pseudoperonospora_cubensis_EU826099:0.01182,Pseudoperonospora_humuli_DQ365763:0.009903)1.00:0.116753,Pseudoperonospora_urticae_DQ365764:0.146246)1.00:0.09369)0.97:0.068739,(((((Plasmopara_angustiterminalis_EU826097:0.002427,Plasmopara_angustiterminalis_EU743812:0.002378)1.00:0.106607,(Plasmopara_sp_ex_Ambr_EU743820:0.00252,(Plasmopara_sp_ex_Ambr_EU743818:0.002547,Plasmopara_sp_ex_Ambr_EU743819:0.002556)0.33:0.002644)1.00:0.06401)1.00:0.087249,(Plasmopara_obducens_DQ365757:0.275315,Plasmopara_halstedii_EU743813:0.166497)0.40:0.047376)0.40:0.035614,((Plasmopara_viticola_DQ365760:0.002699,Plasmopara_viticola_EF426553:0.002777)1.00:0.071568,Plasmopara_muralis_HO_FJ394346:0.098152)1.00:0.135599)0.58:0.032935,Plasmopara_siegesbeckiae_EU743814:0.208622)1.00:0.124543)0.56:0.043865,Graminivora_graminicola_DQ365702:0.188295)0.38:0.020134); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr20659] END;