#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 24, 2025; 3:00 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Dijoux L., Verbruggen H., Mattio L., Duong N., & Payri C.E. 2012. Diversity of Halimeda (Bryopsidales, Chlorophyta) in New Caledonia: a combined morphological and molecular study. Journal of Phycology, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S12336] [ The following blocks are input data for analysis step 8542 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep8542; DIMENSIONS NTAX=27; TAXLABELS 'Halimeda cryptica EF667056 (Jam)' 'Halimeda cryptica EF667057 (Jam)' 'Halimeda cryptica HV958 XX (Jam)' 'Halimeda distorta FJ624644 (Wa)' 'Halimeda fragilis (morphotype D) IRD 4874 (Mal)' 'Halimeda fragilis (morphotype D) IRD 4916 (Mal)' 'Halimeda fragilis (morphotype D) IRD 4917 (Mal)' 'Halimeda fragilis (morphotype D) IRD 5318 (Chest-NC)' 'Halimeda fragilis1 EF667058 (Guam)' 'Halimeda fragilis1 FJ624640 (NM)' 'Halimeda fragilis2 FJ624641 (Phi)' 'Halimeda fragilis2 FJ624642 (Tanz)' 'Halimeda fragilis2 HV1816 XX (Mal)' 'Halimeda fragilis2 HV1828 XX (Mal)' 'Halimeda fragilis2 ODC1772 XX (Phi)' 'Halimeda micronesica (morphotype E) IRD 4862 (Mal)' 'Halimeda micronesica AM049964 (Wal)' 'Halimeda micronesica EF667059 (Wa)' 'Halimeda micronesica EF667060 (Aust)' 'Halimeda micronesica EF667061 (Fiji)' 'Halimeda micronesica H0011 XX (Aust)' 'Halimeda micronesica H0025 XX (Aust)' 'Halimeda micronesica H0083 XX (Cha)' 'Halimeda micronesica H0084 XX (Cha)' 'Halimeda pygmaea EF667062 (Fiji).' 'Halimeda sp. (morphotype D) IRD 5300 (NC)' 'Halimeda sp. (morphotype D) IRD 5319 (Chest-NC)' ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M11443] TITLE Halimeda_L2_tufa_matrix; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep8542; DIMENSIONS NCHAR=821; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] 'Halimeda cryptica EF667056 (Jam)' 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'Halimeda micronesica (morphotype E) IRD 4862 (Mal)' GGAGCAGCACAAATGGACGGTGCTATTTTAGTGGTCTCTGGTGCTGATGGACCGATGCCTCAAACAAAAGAACATATTTTACTGGCACAACAAGTTGGAGTACCTGCTATTGTTGTTTTTCTTAATAAAATTGATCAAGTAGATGATGAAGATTTGCTTGAACTTGTTGAACTTGAAATTCGAGAAACTTTACATCAATATGATTTTCCGGGGGATGATATTGCGATTATAAACGGATCAGCACTGGCTGCTGTGGAAGCATTAACTACAAATCCAATGACTCAAAGGGGTGAAAATGAATGGGTTGATAAAATATATAAATTAATGGATGTTATTGATGAAGAAATCCCTTTGCCACCTCGAAGTACAGACAAAGATTTTTTAATGGCAATTGAAAATGTTGTTTCAATCACAGGTCGTGGCACAGTTGCGACAGGGCGAGTTGAGAGAGGTCAAATAAAAGTAGGAGAAACGATTGAAATCGTAGGTCTTAAAGCAACAAAAGAAACAACGGTTATTGGACTTGAAATGTTTCAAAAAACATTAGAGGAAAGTGTTGCTGGTGATAATGTTGGTGTTTTATTGCGTGGAGTTCAAAAAAATGAAATTCAACGCGGTATGGTTTTAGCAAAACCTGGTTCAATTACACCTCATACACGTTTTAAGGCCCAAGTATATATTTTAAAAAAAGATGAAGGTGGACGCCATACTTCTTTTGTAGCAGGCTATCGACCACAATTTTATGTTCGAACTACAGATGTAACTGGTAAAATTGATTCATTTCAAGGAGATGACGATAGTGAAATTCGTATGGTAATGCC 'Halimeda micronesica AM049964 (Wal)' 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'Halimeda micronesica H0084 XX (Cha)' GGAGCAGCACAAATGGACGGTGCTATTTTAGTGGTCTCTGGTGCTGATGGACCGATGCCTCAAACAAAAGAACATATTTTACTAGCACAACAAGTTGGAGTACCTGCTATTGTTGTCTTTCTGAATAAAATTGATCAAGTAGATGATGAAGATTTGCTTGAACTTGTTGAACTTGAAATTCGAGAAACTTTACATCAATATGATTTTCCGGGGGATGATATTGCGATTATAAACGGATCAGCACTGGCTGCTGTAGAAGCATTAACTACAAATCCAATGACTCAAAGGGGCGAAAATGAATGGGTTGATAAAATATATAAATTAATGGATGTTATTGATGAAGAAATTCCTTTGCCACCTCGAAGTACAGACAAAGATTTTTTAATGGCAATTGAAAATGTTGTTTCAATCACAGGTCGTGGCACAGTTGCGACAGGGCGAGTTGAGAGAGGTCAAATAAAAGTAGGAGAAACGATTGAAATCGTAGGTCTTAAAGCAACAAAAGAAACAACGGTTATTGGACTTGAAATGTTTCAAAAAACATTATAGGAAAGTGTTGCTGGTGATAATGTTGGTGTTTTATTGCGTGGAGTTCAAAAAAATGAAATTCAACGCGGTATGGTTTTAGCAAAACCTGGCTCAATTACACCTCATACACGTTTTAAGGCCCAAGTATATATTTTAAAAAAAGATGAAGGTGGACGCCATACTTCTTTTGTAGCAGGCTATCGACCACAATTTTATGTTCGAACTACAGATGTAACTGGTAAAATTGATTCATTTCAAGGAGATGACGATAGTGAAATTCGTATGGTA????? 'Halimeda pygmaea EF667062 (Fiji).' 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