#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 24, 2025; 2:09 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Dijoux L., Verbruggen H., Mattio L., Duong N., & Payri C.E. 2012. Diversity of Halimeda (Bryopsidales, Chlorophyta) in New Caledonia: a combined morphological and molecular study. Journal of Phycology, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S12336] [ The following blocks are input data for analysis step 8554 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep8554; DIMENSIONS NTAX=98; TAXLABELS 'Halimeda copiosa EF667065 (Jam).' 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Is)' 'Halimeda minima 3 FJ624684 (Aust)' 'Halimeda minima 3 FJ624685 (FP)' 'Halimeda minima 3 FJ624710 (Phi)' 'Halimeda minima 4 FJ624686 (Fiji)' 'Halimeda minima 4 FJ624687 (Phi)' 'Halimeda minima 4 FJ624688 (Fiji)' 'Halimeda minima CP08 415 (FP)' 'Halimeda minima CP08 484 (FP)' 'Halimeda minima CP08 486 (FP)' 'Halimeda minima FJ624668 (Phi)' 'Halimeda minima FJ624708 (FP)' 'Halimeda no ID FJ624704 (NMI)' 'Halimeda no ID FJ624705 (NMI)' 'Halimeda no ID LL0367 XX (Fiji)' 'Halimeda opuntia (morphotype M) CP08 909 (FP)' 'Halimeda opuntia (morphotype M) IRD 5352 (NC)' 'Halimeda opuntia AM049967 (FP)' 'Halimeda opuntia CP08 414 (FP)' 'Halimeda opuntia FJ624690 (Phi)' 'Halimeda renschii FJ624691(Tanz)' 'Halimeda renschii FJ624693 (Tanz)' 'Halimeda renschii FJ624712 (Tanz)' 'Halimeda renschii FJ624717 (Tanz)' 'Halimeda renschii ODC1671 XX (Phi)' 'Halimeda renschii ODC1743 XX (Phi)' 'Halimeda renschii ODC1744 XX (Phi)' 'Halimeda velasquezii (morphotype R) IRD 4935 (Mal)' 'Halimeda velasquezii (morphotype R) IRD 5296 (NC)' 'Halimeda velasquezii FJ624695 (Guam)' 'Halimeda velasquezii FJ624696 (Tanz)' 'Halimeda velasquezii FJ624697 (Phi)' 'Halimeda velasquezii FJ624698 (Phi)' 'Halimeda velasquezii FJ624699 (Phi)' 'Halimeda velasquezii FJ624700 (Tanz)' 'Halimeda velasquezii FJ624701 (Tanz)' 'Halimeda velasquezii FJ624702 (Tanz)' 'Halimeda velasquezii FJ624703 (Tanz)' 'Halimeda velasquezii FJ624711 (Guam)' 'Halimeda velasquezii FJ624715 (Tanz)' 'Halimeda velasquezii FJ624718 (Tanz)' ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M11446] TITLE Halimeda_L5_tufa_matrix; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep8554; DIMENSIONS NCHAR=821; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] 'Halimeda copiosa EF667065 (Jam).' 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'Halimeda minima (morphotype L) IRD 4857 (Mal)' GGAGCTGCTCAAATGGATGGAGCAATTTTAGTAGTGTCTGGTGCGGATGGTCCTATGCCTCAAACAAAAGAACATATTTTATTAGCACAACAAGTTGGAGTACCTGCTATTGTTGTTTTTCTGAACAAAATTGATCAAGTAGATGATGATGATTTACTTGAACTTGTTGAACTTGAAATTCGAGACACTTTAAATAAATATGATTTTCCAGGTGATGATATTCCAATTATTAGTGGTTCGGCATTAGCAGCTGTTGAAGCATTAACTATAAACCCAATGATTCAAAGAAGTGAGAATGAATGGGTTGAGAAAATTTATAAATTAATGGATGTTATTGATGAGGAAATACCTCTACCACTTCGAAATACAGATAAAGATTTTCTCATGGCCATTGAAAATGTTGTTTCCATAACAGGTCGTGGAACAGTTGCGACAGGTAGAGTTGAACGAGGGCAAATAAAAGTAGGACAAACTATTGAAATTGTAGGTCTTAAAGAAACTAAAGAAACAACTGTTATTGGACTTGAAATGTTTCAAAAAACATTAGAAGAAAGTGTTGCTGGTGATAATGTTGGAGTTTTATTGCGTGGTGTTCAAAAAAATGAAATTCAACGCGGTATGGTTTTAGCAAAACCTGGTTCTATTACACCTCATACACGTTTCAAAGCTCAAGTATATGTTTTAAAAAAAGATGAAGGTGGACGTCACACTTCTTTTGTTGCAGGTTATCGACCACAATTTTATGTCCGAACTACAGATGTAACTGGTAAAATTGACTCTTTTCAAGGAGACGATAATAGTGAAATTCGTATGGTTATGCC 'Halimeda minima (morphotype L) IRD 4877 (Mal)' 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